129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1055 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  68.49 
 
 
1447 aa  1809    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  100 
 
 
1451 aa  2840    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.52 
 
 
3589 aa  399  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.07 
 
 
1105 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  40.65 
 
 
2716 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.47 
 
 
4016 aa  333  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.88 
 
 
2834 aa  288  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  43.25 
 
 
1371 aa  288  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  38.13 
 
 
1910 aa  285  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.25 
 
 
2054 aa  284  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  45.98 
 
 
1419 aa  272  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  45.81 
 
 
1148 aa  265  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.61 
 
 
2744 aa  260  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  45.21 
 
 
991 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.93 
 
 
1004 aa  258  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.81 
 
 
985 aa  255  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.46 
 
 
5613 aa  254  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  43.86 
 
 
1003 aa  253  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.87 
 
 
1137 aa  252  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  45.89 
 
 
770 aa  251  6e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  48.97 
 
 
2334 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  44.92 
 
 
2328 aa  244  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  43.57 
 
 
1417 aa  243  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.66 
 
 
956 aa  243  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  42.15 
 
 
2079 aa  242  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  38.71 
 
 
1999 aa  241  9e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.58 
 
 
800 aa  238  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  45.86 
 
 
1081 aa  237  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  43.2 
 
 
1058 aa  236  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  41.02 
 
 
1009 aa  236  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.04 
 
 
2387 aa  235  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  43.35 
 
 
1018 aa  232  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  35.67 
 
 
1691 aa  221  7e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.24 
 
 
4500 aa  221  8.999999999999998e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.16 
 
 
3132 aa  221  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.94 
 
 
607 aa  218  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.39 
 
 
2217 aa  217  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  38.57 
 
 
2271 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  41.29 
 
 
390 aa  213  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  38.08 
 
 
1994 aa  213  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.43 
 
 
2887 aa  198  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  40.53 
 
 
1169 aa  196  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.5 
 
 
1637 aa  192  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.75 
 
 
4855 aa  190  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.47 
 
 
481 aa  169  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.38 
 
 
3340 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  35.55 
 
 
3299 aa  135  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.59 
 
 
2637 aa  133  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.04 
 
 
1844 aa  133  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.27 
 
 
808 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  29.39 
 
 
2679 aa  129  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  37.1 
 
 
1013 aa  126  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  33.16 
 
 
1741 aa  124  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  33.04 
 
 
715 aa  121  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.93 
 
 
759 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.72 
 
 
3535 aa  111  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  33 
 
 
4049 aa  110  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.51 
 
 
3419 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  32.5 
 
 
3349 aa  109  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  34.11 
 
 
4007 aa  109  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.19 
 
 
3299 aa  109  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  37.37 
 
 
1672 aa  107  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.05 
 
 
3537 aa  101  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.92 
 
 
3298 aa  99.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  32.72 
 
 
4347 aa  97.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  32.22 
 
 
4030 aa  96.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  31.23 
 
 
4135 aa  92.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  30.26 
 
 
3472 aa  89.4  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  37.5 
 
 
4009 aa  89.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  31.6 
 
 
4170 aa  86.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  32.05 
 
 
3332 aa  85.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  30.8 
 
 
4184 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  28.39 
 
 
3409 aa  82.8  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  36.11 
 
 
4132 aa  81.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  30.18 
 
 
4177 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  43.36 
 
 
4435 aa  77.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.27 
 
 
946 aa  76.3  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.71 
 
 
4219 aa  74.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.18 
 
 
1772 aa  71.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  38.64 
 
 
1882 aa  66.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1009  hypothetical protein  43.02 
 
 
122 aa  65.9  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  38.71 
 
 
4283 aa  65.1  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  35.62 
 
 
1526 aa  63.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4181  filamentous haemagglutinin-like protein  33.75 
 
 
759 aa  62.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  30.96 
 
 
2296 aa  60.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0837  hemagglutination domain-containing protein  36.04 
 
 
139 aa  58.9  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0185805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  37.5 
 
 
2642 aa  58.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  31.13 
 
 
1971 aa  57  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2359  hypothetical protein  48.08 
 
 
212 aa  57.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.486627  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1530  conserved hypothetical protein, hemagglutination domain protein  37.12 
 
 
1085 aa  56.6  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.307259  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.53 
 
 
1570 aa  55.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.84 
 
 
1349 aa  55.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.84 
 
 
1391 aa  55.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2972  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.2 
 
 
823 aa  55.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  38.06 
 
 
3506 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  37.34 
 
 
2578 aa  54.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0379  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.68 
 
 
1073 aa  53.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0161593  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3737  filamentous haemagglutinin-like protein  38.3 
 
 
805 aa  53.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  29.48 
 
 
3920 aa  53.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  37.58 
 
 
2906 aa  52.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>