105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0940 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  50.87 
 
 
1999 aa  1406    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  100 
 
 
1691 aa  3318    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  49.04 
 
 
1215 aa  493  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.04 
 
 
5613 aa  436  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41 
 
 
1105 aa  284  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  41.97 
 
 
2716 aa  280  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  36.17 
 
 
1451 aa  255  6e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  36.98 
 
 
1447 aa  253  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.88 
 
 
4855 aa  233  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.25 
 
 
800 aa  222  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.28 
 
 
3589 aa  212  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.96 
 
 
956 aa  210  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  47.35 
 
 
770 aa  208  9e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  45.9 
 
 
607 aa  205  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.69 
 
 
2387 aa  205  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.26 
 
 
2217 aa  204  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.84 
 
 
985 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  45.34 
 
 
1419 aa  201  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  44.16 
 
 
1003 aa  198  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.84 
 
 
1081 aa  198  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  43.61 
 
 
2334 aa  197  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  43.7 
 
 
2328 aa  196  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.35 
 
 
4016 aa  194  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.67 
 
 
1004 aa  192  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.44 
 
 
2887 aa  191  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  43.08 
 
 
1009 aa  191  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  43.49 
 
 
1058 aa  191  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  39.53 
 
 
1417 aa  188  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  42.91 
 
 
991 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.51 
 
 
1148 aa  186  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.98 
 
 
2834 aa  185  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  42.86 
 
 
1018 aa  184  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  39.15 
 
 
1910 aa  179  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.76 
 
 
2054 aa  179  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  39.57 
 
 
2079 aa  175  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  34.92 
 
 
1371 aa  173  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  36.51 
 
 
1672 aa  173  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.25 
 
 
4500 aa  169  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.24 
 
 
3132 aa  163  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.87 
 
 
481 aa  159  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.28 
 
 
2744 aa  156  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  36.73 
 
 
390 aa  151  8e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.08 
 
 
1637 aa  150  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  29.35 
 
 
1994 aa  149  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  30.67 
 
 
2271 aa  149  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  37.02 
 
 
1169 aa  147  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.55 
 
 
1844 aa  134  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30 
 
 
3419 aa  121  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.31 
 
 
3535 aa  119  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  29.76 
 
 
2679 aa  115  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 
3340 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.65 
 
 
3299 aa  114  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.07 
 
 
3537 aa  112  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.76 
 
 
3298 aa  108  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  28.93 
 
 
3299 aa  108  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  31.85 
 
 
715 aa  104  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.8 
 
 
808 aa  100  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  30.6 
 
 
3332 aa  98.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  31.69 
 
 
3349 aa  97.8  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  29.68 
 
 
1741 aa  97.1  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.23 
 
 
759 aa  95.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  28.95 
 
 
4007 aa  91.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  28.18 
 
 
4177 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  35.09 
 
 
1013 aa  87  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  30.88 
 
 
4049 aa  83.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  27.94 
 
 
4132 aa  83.2  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  27.81 
 
 
4009 aa  82.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  27.84 
 
 
4184 aa  82.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  31.18 
 
 
4135 aa  81.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  26.74 
 
 
4347 aa  79.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.8 
 
 
946 aa  75.5  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  29.38 
 
 
4170 aa  75.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  28.9 
 
 
4030 aa  73.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.71 
 
 
1650 aa  72.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  31.61 
 
 
4435 aa  70.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.5 
 
 
2637 aa  69.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.73 
 
 
4219 aa  65.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  28.09 
 
 
3472 aa  63.9  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1755  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.88 
 
 
965 aa  63.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655087 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  34.07 
 
 
1323 aa  62.8  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  31.96 
 
 
4283 aa  62  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1530  conserved hypothetical protein, hemagglutination domain protein  31.25 
 
 
1085 aa  60.5  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.307259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  29.2 
 
 
3409 aa  60.1  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.81 
 
 
1570 aa  57.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.14 
 
 
11716 aa  55.8  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.84 
 
 
1349 aa  55.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0837  hemagglutination domain-containing protein  36.22 
 
 
139 aa  53.9  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0185805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1154  surface protein  34.97 
 
 
4713 aa  53.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.31 
 
 
1391 aa  52.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0529  putative periplasmic protein  33.88 
 
 
553 aa  51.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.935894  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1743  putative periplasmic protein  33.88 
 
 
553 aa  51.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  34.78 
 
 
3598 aa  52  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  30.88 
 
 
2954 aa  51.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3737  filamentous haemagglutinin-like protein  23.87 
 
 
805 aa  50.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.94 
 
 
1772 aa  50.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  28.05 
 
 
2001 aa  49.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3762  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.48 
 
 
5342 aa  50.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1390  filamentous haemagglutinin-like protein  35.62 
 
 
1033 aa  48.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.379495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4181  filamentous haemagglutinin-like protein  30.67 
 
 
759 aa  46.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153742 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1009  hypothetical protein  39.73 
 
 
122 aa  46.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>