113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2394 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
4500 aa  8403    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.12 
 
 
5613 aa  759    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  40.6 
 
 
1419 aa  416  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.86 
 
 
1148 aa  380  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  36.52 
 
 
991 aa  382  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.67 
 
 
1081 aa  373  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  41.26 
 
 
2328 aa  367  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.88 
 
 
1137 aa  362  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  50.37 
 
 
2334 aa  355  8e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  37.18 
 
 
1058 aa  353  6e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.5 
 
 
2387 aa  348  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  35.27 
 
 
1003 aa  348  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  48.17 
 
 
770 aa  333  7e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  34.78 
 
 
1009 aa  328  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.6 
 
 
1004 aa  319  9e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.74 
 
 
985 aa  313  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  32.89 
 
 
1994 aa  311  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.48 
 
 
4855 aa  308  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  34.75 
 
 
1018 aa  297  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  40.26 
 
 
2079 aa  290  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.97 
 
 
800 aa  288  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.59 
 
 
607 aa  271  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.43 
 
 
1105 aa  268  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  46.44 
 
 
1672 aa  257  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  42.59 
 
 
2716 aa  245  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.7 
 
 
4016 aa  241  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  37.94 
 
 
390 aa  229  1e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  47.44 
 
 
1371 aa  228  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  42.24 
 
 
1451 aa  222  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.85 
 
 
2054 aa  222  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  40.8 
 
 
1447 aa  218  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  35.85 
 
 
1910 aa  217  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  39.26 
 
 
1439 aa  216  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  39.47 
 
 
1169 aa  211  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  33.63 
 
 
1013 aa  208  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.8 
 
 
3589 aa  203  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.61 
 
 
2834 aa  184  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.01 
 
 
3132 aa  173  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  37.96 
 
 
1999 aa  171  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  40.33 
 
 
1275 aa  169  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  33.78 
 
 
2271 aa  166  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  27.82 
 
 
3920 aa  153  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40 
 
 
2217 aa  151  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.04 
 
 
2887 aa  151  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.07 
 
 
2744 aa  146  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  38.25 
 
 
1691 aa  146  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.77 
 
 
1637 aa  139  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  31.93 
 
 
2296 aa  137  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.03 
 
 
481 aa  135  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.65 
 
 
759 aa  134  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.99 
 
 
1844 aa  134  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  35.19 
 
 
2927 aa  130  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  31.92 
 
 
1526 aa  127  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.11 
 
 
808 aa  119  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.19 
 
 
956 aa  119  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  29.19 
 
 
715 aa  117  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  34.23 
 
 
1417 aa  114  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  32.79 
 
 
1741 aa  113  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  28.43 
 
 
3299 aa  112  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.32 
 
 
3340 aa  108  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  42.75 
 
 
3349 aa  104  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  41.61 
 
 
2679 aa  103  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  42.44 
 
 
4007 aa  102  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  39.44 
 
 
4347 aa  102  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  40.24 
 
 
4135 aa  100  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  33.23 
 
 
3472 aa  97.8  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  37.3 
 
 
4009 aa  97.1  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  39.25 
 
 
4435 aa  97.1  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  40.56 
 
 
4049 aa  95.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  36.4 
 
 
1672 aa  92  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  34.76 
 
 
3332 aa  87  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  35.65 
 
 
4177 aa  85.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  32.66 
 
 
3333 aa  85.5  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  31.35 
 
 
4132 aa  85.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  38.89 
 
 
1585 aa  85.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  37.36 
 
 
1588 aa  84.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  32.55 
 
 
4030 aa  82.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  38.24 
 
 
4184 aa  81.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  37.42 
 
 
1467 aa  81.3  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  49.48 
 
 
4283 aa  80.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  33.69 
 
 
3409 aa  79  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  36.67 
 
 
1977 aa  79.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  42.22 
 
 
1241 aa  78.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.98 
 
 
4219 aa  75.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  35.05 
 
 
4170 aa  73.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4098  hypothetical protein  34.9 
 
 
1064 aa  72.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.17 
 
 
946 aa  72  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.73 
 
 
1650 aa  70.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03190  hypothetical protein  29.8 
 
 
2400 aa  70.5  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000427752 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0104  cell wall/surface repeat protein  27.65 
 
 
2099 aa  67.8  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0837  hemagglutination domain-containing protein  36.21 
 
 
139 aa  66.6  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0185805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  35.34 
 
 
1937 aa  62.4  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.2 
 
 
3299 aa  60.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.23 
 
 
3535 aa  59.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.23 
 
 
3419 aa  59.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1530  conserved hypothetical protein, hemagglutination domain protein  34.83 
 
 
1085 aa  59.3  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.307259  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.23 
 
 
3537 aa  58.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0760  hemagglutination domain-containing protein  36.21 
 
 
144 aa  57  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.955622  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1009  hypothetical protein  40.58 
 
 
122 aa  56.6  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0747  GLUG  34.07 
 
 
454 aa  55.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.120548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>