55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1009 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1009  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  242  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  95.19 
 
 
390 aa  199  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  93.07 
 
 
1169 aa  184  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  51.02 
 
 
1058 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  50 
 
 
2334 aa  94  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  50.47 
 
 
2328 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  63.77 
 
 
1081 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  60.56 
 
 
607 aa  87  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  57.75 
 
 
2387 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  48.78 
 
 
2079 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  49.28 
 
 
2887 aa  72  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.18 
 
 
481 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.94 
 
 
4016 aa  69.3  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.05 
 
 
1105 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  45.21 
 
 
770 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  45.71 
 
 
2716 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  47.22 
 
 
1003 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.37 
 
 
800 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  43.02 
 
 
1451 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  45.59 
 
 
5613 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.05 
 
 
1137 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.94 
 
 
985 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  41.86 
 
 
1447 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  46.27 
 
 
3349 aa  62.8  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  44.16 
 
 
2271 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  44.16 
 
 
1994 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  49.3 
 
 
2217 aa  61.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  52.31 
 
 
1371 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  45.31 
 
 
3589 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.58 
 
 
4500 aa  57  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  57.45 
 
 
2679 aa  57  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  39.51 
 
 
1999 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  49.18 
 
 
3132 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  50 
 
 
1419 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.48 
 
 
4855 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2359  hypothetical protein  46.15 
 
 
212 aa  53.5  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.486627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.3 
 
 
2744 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.69 
 
 
1004 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  42.47 
 
 
1018 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  41.67 
 
 
1417 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  41.03 
 
 
1009 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.44 
 
 
1148 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  40.85 
 
 
991 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  44.29 
 
 
715 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.71 
 
 
956 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.31 
 
 
2054 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  39.73 
 
 
1691 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.81 
 
 
759 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  37.31 
 
 
1910 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.71 
 
 
1637 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  40.3 
 
 
1741 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1279  hypothetical protein  41.07 
 
 
105 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  45 
 
 
4009 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.22 
 
 
4219 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  47.37 
 
 
4170 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.336923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>