75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0504 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  100 
 
 
1844 aa  3539    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.76 
 
 
946 aa  189  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.31 
 
 
1081 aa  167  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  34.7 
 
 
1058 aa  165  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  36.19 
 
 
2328 aa  164  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  35.43 
 
 
2334 aa  162  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.07 
 
 
800 aa  160  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.05 
 
 
607 aa  160  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.96 
 
 
2387 aa  159  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.97 
 
 
985 aa  158  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.66 
 
 
1137 aa  151  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  38.59 
 
 
2716 aa  149  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  35.77 
 
 
1003 aa  149  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.19 
 
 
3589 aa  146  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  33.16 
 
 
991 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  34.22 
 
 
1419 aa  144  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  35.62 
 
 
1018 aa  144  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.88 
 
 
3132 aa  143  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  41.67 
 
 
1371 aa  143  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  35.29 
 
 
1009 aa  142  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.89 
 
 
1004 aa  141  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.9 
 
 
1148 aa  141  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  34.86 
 
 
770 aa  138  9e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  35.08 
 
 
2079 aa  138  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  33 
 
 
1999 aa  138  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.8 
 
 
1105 aa  137  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.1 
 
 
4500 aa  134  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  35.41 
 
 
1451 aa  132  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  35.86 
 
 
1447 aa  131  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.3 
 
 
2744 aa  127  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.98 
 
 
5613 aa  124  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.59 
 
 
4016 aa  123  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.18 
 
 
4855 aa  123  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.83 
 
 
2887 aa  118  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  34.3 
 
 
2271 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  34.66 
 
 
1994 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  35.56 
 
 
1691 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.48 
 
 
2834 aa  114  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  31.23 
 
 
390 aa  112  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.36 
 
 
481 aa  110  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  33.01 
 
 
1169 aa  108  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.46 
 
 
2217 aa  105  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.27 
 
 
1637 aa  103  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.91 
 
 
2054 aa  102  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  33.98 
 
 
1910 aa  97.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 
956 aa  90.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  32.14 
 
 
4347 aa  90.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  36.42 
 
 
4135 aa  86.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  30.69 
 
 
3299 aa  85.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.07 
 
 
3340 aa  84.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  33.98 
 
 
4132 aa  84.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  29.32 
 
 
4030 aa  84.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  50.55 
 
 
2679 aa  84.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  35.96 
 
 
4009 aa  82.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  29.18 
 
 
3332 aa  82  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  31.27 
 
 
4049 aa  80.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  28.89 
 
 
1741 aa  79.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.96 
 
 
4219 aa  78.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  33.53 
 
 
4007 aa  77  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  28.98 
 
 
3472 aa  77  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.17 
 
 
2637 aa  76.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  32.05 
 
 
4177 aa  74.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  30.57 
 
 
4170 aa  74.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  31.96 
 
 
4435 aa  73.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  39.58 
 
 
3349 aa  72.4  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  30.92 
 
 
4184 aa  72.8  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.56 
 
 
808 aa  72  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  29.07 
 
 
3409 aa  69.7  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  31.79 
 
 
1013 aa  64.3  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.71 
 
 
759 aa  62  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  31.06 
 
 
715 aa  59.7  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  26.23 
 
 
4283 aa  59.3  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3762  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.12 
 
 
5342 aa  56.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0651  hypothetical protein  36.52 
 
 
3954 aa  46.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.54 
 
 
3299 aa  45.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>