66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0421 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  100 
 
 		 1323 aa  2634    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3555  hypothetical protein  39.36 
 
 		 616 aa  242  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  36.64 
 
 		 983 aa  234  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  36.48 
 
 		 1631 aa  194  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  33.46 
 
 		 1241 aa  162  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1877  hypothetical protein  34.07 
 
 		 607 aa  158  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215725  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  33.17 
 
 		 690 aa  157  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  38.83 
 
 		 1421 aa  151  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  34.53 
 
 		 3391 aa  129  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  30.56 
 
 		 4723 aa  127  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  35.07 
 
 		 5899 aa  126  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0433  hypothetical protein  30.98 
 
 		 568 aa  127  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.701978  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  32.6 
 
 		 2193 aa  119  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  36.04 
 
 		 1202 aa  93.6  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3273  hypothetical protein  30.64 
 
 		 587 aa  94  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000120347  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0098  Cna B domain-containing protein  51.81 
 
 		 138 aa  88.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.685071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  32.47 
 
 		 4231 aa  87  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  31.12 
 
 		 642 aa  84.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3284  hypothetical protein  27.46 
 
 		 524 aa  82.4  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.323692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  29.1 
 
 		 653 aa  80.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.82 
 
 		 5787 aa  78.6  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3274  hypothetical protein  27.7 
 
 		 587 aa  76.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000551776  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  31.5 
 
 		 2251 aa  75.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.48 
 
 		 3363 aa  75.1  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  31.8 
 
 		 3132 aa  73.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  27 
 
 		 635 aa  70.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  30.46 
 
 		 2890 aa  69.3  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  33.06 
 
 		 2853 aa  69.3  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  28.47 
 
 		 2820 aa  69.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  30.53 
 
 		 1134 aa  68.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  34 
 
 		 2133 aa  67.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  32.16 
 
 		 3508 aa  65.1  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  33.82 
 
 		 6678 aa  63.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  34.59 
 
 		 8871 aa  62.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  44.33 
 
 		 1389 aa  62.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  34.07 
 
 		 1691 aa  62  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  28.93 
 
 		 1014 aa  60.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  32.73 
 
 		 16311 aa  60.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  28.15 
 
 		 2001 aa  58.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  30.57 
 
 		 2132 aa  58.5  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  41.18 
 
 		 1727 aa  57.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1784  hypothetical protein  29.52 
 
 		 550 aa  57  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.135796  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  32.02 
 
 		 1867 aa  57  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.59 
 
 		 11716 aa  54.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  41.24 
 
 		 488 aa  54.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  29.08 
 
 		 3714 aa  53.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  34.82 
 
 		 3954 aa  54.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.71 
 
 		 1019 aa  53.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  40.24 
 
 		 2461 aa  52  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.16 
 
 		 14916 aa  51.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  24.9 
 
 		 4465 aa  50.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  43.33 
 
 		 1838 aa  49.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  31.51 
 
 		 8980 aa  49.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.65 
 
 		 5613 aa  48.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  23.94 
 
 		 2743 aa  48.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  33.78 
 
 		 1055 aa  48.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  29.15 
 
 		 3066 aa  48.5  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  36.05 
 
 		 5094 aa  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.02 
 
 		 2507 aa  47.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  32.1 
 
 		 928 aa  47  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  29.84 
 
 		 3598 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  27.81 
 
 		 1166 aa  46.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  35 
 
 		 426 aa  46.2  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  32.31 
 
 		 5769 aa  45.8  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  29.15 
 
 		 2079 aa  45.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0905  Ig family protein  33.33 
 
 		 3230 aa  45.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>