15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0098 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0098  Cna B domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.685071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  51.43 
 
 		 690 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  56.25 
 
 		 983 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3555  hypothetical protein  52.44 
 
 		 616 aa  90.1  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507708  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0433  hypothetical protein  48.81 
 
 		 568 aa  89.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.701978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  51.81 
 
 		 1323 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  45.37 
 
 		 1241 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  50 
 
 		 653 aa  72.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1877  hypothetical protein  47.44 
 
 		 607 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215725  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  39.51 
 
 		 635 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  32.52 
 
 		 642 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3274  hypothetical protein  46.27 
 
 		 587 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000551776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3273  hypothetical protein  39.13 
 
 		 587 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000120347  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3284  hypothetical protein  38.1 
 
 		 524 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.323692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1784  hypothetical protein  39.06 
 
 		 550 aa  43.5  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.135796  normal  0.121637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>