14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3274 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3273  hypothetical protein  66.55 
 
 
587 aa  772    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000120347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3274  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1201    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000551776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  30.64 
 
 
983 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3555  hypothetical protein  29.46 
 
 
616 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  27.99 
 
 
1241 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  25.69 
 
 
690 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1877  hypothetical protein  25 
 
 
607 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215725  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  27.63 
 
 
1323 aa  77  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0433  hypothetical protein  32.11 
 
 
568 aa  75.1  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.701978  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  37.29 
 
 
642 aa  67.4  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  33.62 
 
 
635 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0098  Cna B domain-containing protein  46.27 
 
 
138 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.685071 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3284  hypothetical protein  25.41 
 
 
524 aa  53.5  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.323692  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  26.34 
 
 
653 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>