15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0433 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0433  hypothetical protein  100 
 
 
568 aa  1169    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.701978  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3555  hypothetical protein  33.41 
 
 
616 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  34.33 
 
 
983 aa  192  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  32.71 
 
 
690 aa  170  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  30.86 
 
 
1241 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  31.58 
 
 
1323 aa  131  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1877  hypothetical protein  30.58 
 
 
607 aa  113  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215725  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  33.01 
 
 
642 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  34.62 
 
 
635 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3284  hypothetical protein  25.44 
 
 
524 aa  89.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.323692  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0098  Cna B domain-containing protein  48.81 
 
 
138 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.685071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3273  hypothetical protein  27.94 
 
 
587 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000120347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  31.25 
 
 
653 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3274  hypothetical protein  32.11 
 
 
587 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000551776  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1784  hypothetical protein  29.24 
 
 
550 aa  65.1  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.135796  normal  0.121637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>