15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3273 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3273  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1184    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000120347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3274  hypothetical protein  65.76 
 
 
587 aa  791    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000551776  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3555  hypothetical protein  31.84 
 
 
616 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507708  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  27.6 
 
 
690 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  31.44 
 
 
983 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  30.84 
 
 
1241 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1877  hypothetical protein  29.25 
 
 
607 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215725  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  30.64 
 
 
1323 aa  94  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0433  hypothetical protein  28.16 
 
 
568 aa  85.5  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.701978  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3284  hypothetical protein  27.22 
 
 
524 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.323692  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  36.44 
 
 
642 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1784  hypothetical protein  28.5 
 
 
550 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.135796  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0098  Cna B domain-containing protein  39.13 
 
 
138 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.685071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  33.62 
 
 
635 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  32.74 
 
 
653 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>