15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3284 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3284  hypothetical protein  100 
 
 
524 aa  1073    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.323692  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  25 
 
 
983 aa  107  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3555  hypothetical protein  27.83 
 
 
616 aa  97.8  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507708  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0433  hypothetical protein  25.44 
 
 
568 aa  86.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.701978  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  27.46 
 
 
1323 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1877  hypothetical protein  28.01 
 
 
607 aa  78.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215725  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1784  hypothetical protein  25.55 
 
 
550 aa  71.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.135796  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  26.71 
 
 
690 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  26.63 
 
 
1241 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3273  hypothetical protein  27.22 
 
 
587 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000120347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  22.77 
 
 
653 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  22.7 
 
 
642 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  23.88 
 
 
635 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3274  hypothetical protein  25.41 
 
 
587 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000551776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0098  Cna B domain-containing protein  38.1 
 
 
138 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.685071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>