100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0279 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  100 
 
 		 5899 aa  11510    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  57.56 
 
 		 2193 aa  477  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  40.61 
 
 		 3391 aa  243  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.15 
 
 		 1340 aa  224  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.76 
 
 		 1800 aa  220  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  36.71 
 
 		 1631 aa  204  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.44 
 
 		 2194 aa  196  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.97 
 
 		 1661 aa  196  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.04 
 
 		 1222 aa  180  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  32.85 
 
 		 2890 aa  177  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.02 
 
 		 1225 aa  177  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.75 
 
 		 3396 aa  162  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.78 
 
 		 1113 aa  158  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  29.74 
 
 		 1029 aa  158  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.43 
 
 		 1029 aa  156  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.48 
 
 		 1118 aa  154  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.77 
 
 		 1269 aa  151  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.36 
 
 		 1269 aa  149  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  31.25 
 
 		 2310 aa  144  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0736  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.59 
 
 		 1021 aa  142  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  37.08 
 
 		 1421 aa  139  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  37.5 
 
 		 1037 aa  132  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  29.18 
 
 		 4723 aa  129  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  24.89 
 
 		 4013 aa  127  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  33.33 
 
 		 2305 aa  125  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  34.83 
 
 		 1323 aa  125  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.7 
 
 		 889 aa  124  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.33 
 
 		 1012 aa  114  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.42 
 
 		 1009 aa  113  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  31.2 
 
 		 2251 aa  103  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  29.3 
 
 		 1031 aa  102  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.32 
 
 		 891 aa  102  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.17 
 
 		 1180 aa  102  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  33.76 
 
 		 1134 aa  100  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.82 
 
 		 928 aa  88.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.37 
 
 		 768 aa  83.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.55 
 
 		 3168 aa  80.5  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  43.7 
 
 		 2667 aa  78.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  44.44 
 
 		 2775 aa  78.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  28.23 
 
 		 3544 aa  75.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  35.39 
 
 		 2885 aa  73.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  31.64 
 
 		 3927 aa  73.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  35.71 
 
 		 1315 aa  72.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  29.72 
 
 		 3193 aa  71.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  29.05 
 
 		 2402 aa  69.7  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  27.85 
 
 		 2522 aa  63.9  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  34.44 
 
 		 8871 aa  64.3  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 		 3699 aa  63.9  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  31.47 
 
 		 2625 aa  63.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2271  Hemolysin-type calcium-binding region  31.13 
 
 		 272 aa  63.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.820331  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  34.19 
 
 		 820 aa  63.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  27.82 
 
 		 4687 aa  63.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  33.66 
 
 		 1202 aa  62.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.12 
 
 		 1415 aa  63.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.93 
 
 		 5098 aa  62.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  30.64 
 
 		 1389 aa  62.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  31.07 
 
 		 956 aa  61.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  36.91 
 
 		 2796 aa  60.8  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3672  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.31 
 
 		 255 aa  60.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  26.37 
 
 		 3699 aa  59.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  30.9 
 
 		 2456 aa  59.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  33.03 
 
 		 1222 aa  58.5  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  26.88 
 
 		 3562 aa  58.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  37.39 
 
 		 16311 aa  57.4  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4726  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.67 
 
 		 826 aa  57  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  25.05 
 
 		 3598 aa  56.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  31.38 
 
 		 1014 aa  56.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  29.38 
 
 		 959 aa  55.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  27.68 
 
 		 7284 aa  55.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 783 aa  55.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  40.35 
 
 		 4231 aa  54.7  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1952  hypothetical protein  34.4 
 
 		 1538 aa  54.7  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131034  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  28.72 
 
 		 4848 aa  53.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.38 
 
 		 615 aa  52.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 1091 aa  52  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  23.91 
 
 		 3204 aa  52  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.57 
 
 		 1372 aa  52.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  34.19 
 
 		 2836 aa  52  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  23.91 
 
 		 2911 aa  52  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  42.42 
 
 		 1350 aa  51.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  31.43 
 
 		 932 aa  51.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  42.42 
 
 		 1806 aa  51.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.37 
 
 		 5787 aa  50.8  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.47 
 
 		 2507 aa  50.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.9 
 
 		 547 aa  50.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  27.65 
 
 		 1867 aa  50.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  27.74 
 
 		 3834 aa  49.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0174  hypothetical protein  32.82 
 
 		 438 aa  49.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.023441  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  26.64 
 
 		 2701 aa  49.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  32.04 
 
 		 750 aa  49.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  24.64 
 
 		 4285 aa  49.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  26.96 
 
 		 2024 aa  48.5  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  27.61 
 
 		 7919 aa  48.5  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  29.96 
 
 		 5561 aa  48.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  30.72 
 
 		 2329 aa  48.5  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.82 
 
 		 647 aa  48.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.19 
 
 		 11716 aa  48.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  32 
 
 		 1884 aa  48.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  26.35 
 
 		 1141 aa  47.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.17 
 
 		 1092 aa  47.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>