128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0430 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  87.55 
 
 		 1091 aa  1837    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 1092 aa  2163    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  62.87 
 
 		 1075 aa  207  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.28 
 
 		 940 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.91 
 
 		 826 aa  164  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.17 
 
 		 955 aa  156  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.94 
 
 		 947 aa  156  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.82 
 
 		 945 aa  156  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  42.74 
 
 		 948 aa  152  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.24 
 
 		 1266 aa  151  7e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.53 
 
 		 944 aa  149  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  41.94 
 
 		 948 aa  147  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  41.94 
 
 		 948 aa  145  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.9 
 
 		 942 aa  144  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  46.67 
 
 		 780 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  48.37 
 
 		 944 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  44.38 
 
 		 780 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  47.83 
 
 		 948 aa  140  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.9 
 
 		 818 aa  140  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  47.83 
 
 		 944 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.9 
 
 		 818 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2671  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.18 
 
 		 470 aa  139  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0295423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  47.28 
 
 		 944 aa  138  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  47.28 
 
 		 944 aa  138  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.16 
 
 		 848 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  35.84 
 
 		 1310 aa  116  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.25 
 
 		 1795 aa  110  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.7 
 
 		 885 aa  100  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.64 
 
 		 940 aa  99  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  38.05 
 
 		 865 aa  98.2  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.62 
 
 		 870 aa  96.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.64 
 
 		 810 aa  96.3  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.39 
 
 		 1073 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.28 
 
 		 892 aa  95.5  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.98 
 
 		 871 aa  94.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1076 aa  92  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.5 
 
 		 870 aa  90.9  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.02 
 
 		 876 aa  90.5  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.13 
 
 		 870 aa  90.1  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  36.9 
 
 		 614 aa  89.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.59 
 
 		 870 aa  89  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  39.5 
 
 		 869 aa  87.8  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.86 
 
 		 873 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  36.09 
 
 		 1346 aa  86.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.34 
 
 		 870 aa  84.7  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.59 
 
 		 870 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.25 
 
 		 870 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.15 
 
 		 894 aa  84  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.8 
 
 		 870 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1932  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.3 
 
 		 802 aa  82.4  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  36.65 
 
 		 871 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.17 
 
 		 592 aa  80.9  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0195  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.57 
 
 		 821 aa  77.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937646  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  36 
 
 		 982 aa  77  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  36.93 
 
 		 617 aa  75.5  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09210)  26.44 
 
 		 600 aa  74.7  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1618  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  24.91 
 
 		 1710 aa  71.6  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.7 
 
 		 1010 aa  69.7  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.434546 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  25.18 
 
 		 802 aa  69.7  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.45 
 
 		 2194 aa  69.3  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3663  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.11 
 
 		 586 aa  69.3  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00731274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  37.61 
 
 		 2310 aa  68.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1073  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.64 
 
 		 597 aa  67.8  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.03 
 
 		 1009 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  31.72 
 
 		 890 aa  67.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.26 
 
 		 1052 aa  66.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  34.23 
 
 		 2305 aa  64.7  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  28.37 
 
 		 1037 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.94 
 
 		 1012 aa  63.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.31 
 
 		 1052 aa  63.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.85 
 
 		 1118 aa  62  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  21.2 
 
 		 788 aa  62  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.63 
 
 		 1222 aa  61.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.81 
 
 		 790 aa  61.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  32.04 
 
 		 984 aa  60.1  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.45 
 
 		 647 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.78 
 
 		 1113 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.19 
 
 		 891 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.78 
 
 		 889 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.93 
 
 		 1340 aa  58.9  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.81 
 
 		 601 aa  58.5  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.85 
 
 		 1225 aa  58.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.57 
 
 		 1284 aa  58.2  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.14 
 
 		 928 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.03 
 
 		 788 aa  56.6  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  21.23 
 
 		 788 aa  57.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.06 
 
 		 788 aa  55.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.97 
 
 		 1269 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.97 
 
 		 1269 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  21.16 
 
 		 788 aa  55.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.34 
 
 		 2346 aa  55.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.17 
 
 		 1800 aa  54.7  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  21.33 
 
 		 788 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  36.04 
 
 		 2796 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1063  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.38 
 
 		 554 aa  53.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  21.38 
 
 		 788 aa  52.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.52 
 
 		 929 aa  52.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.88 
 
 		 788 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1075  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.74 
 
 		 583 aa  51.6  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  23.46 
 
 		 788 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>