91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3185 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 
768 aa  1541    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.74 
 
 
1269 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.74 
 
 
1269 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.27 
 
 
928 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  44.72 
 
 
1037 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.22 
 
 
1009 aa  167  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  41.06 
 
 
2310 aa  163  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.84 
 
 
1012 aa  157  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  40.24 
 
 
2305 aa  157  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.02 
 
 
1340 aa  157  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.91 
 
 
2194 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.55 
 
 
891 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.05 
 
 
1800 aa  151  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4303  peptidase-like  47.34 
 
 
1289 aa  151  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0594037  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.56 
 
 
1222 aa  147  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.96 
 
 
1225 aa  146  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.44 
 
 
1118 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.44 
 
 
1113 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.91 
 
 
889 aa  144  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.33 
 
 
1661 aa  127  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  29.31 
 
 
648 aa  120  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  29.81 
 
 
535 aa  105  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  29.95 
 
 
1134 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  30.16 
 
 
535 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  29.86 
 
 
745 aa  99.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  31.34 
 
 
1133 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  32.62 
 
 
1029 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.94 
 
 
1029 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.48 
 
 
1180 aa  93.6  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  31.8 
 
 
478 aa  92  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  31.03 
 
 
480 aa  87.4  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  29.13 
 
 
476 aa  84.7  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.57 
 
 
1415 aa  84.7  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  29.2 
 
 
490 aa  83.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  32.37 
 
 
5899 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  27.89 
 
 
474 aa  82.4  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  29.83 
 
 
504 aa  81.6  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.31 
 
 
3396 aa  81.3  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  29.68 
 
 
481 aa  80.5  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  28.17 
 
 
486 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.96 
 
 
647 aa  78.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  31.75 
 
 
2796 aa  79  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  29.62 
 
 
444 aa  75.9  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  29.71 
 
 
476 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  28.37 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  30.87 
 
 
479 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.19 
 
 
3168 aa  74.3  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  25.07 
 
 
713 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  40 
 
 
894 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  24.8 
 
 
713 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  30.74 
 
 
479 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3672  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.55 
 
 
255 aa  72  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  28.29 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.78 
 
 
8871 aa  71.6  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  41.51 
 
 
5444 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  28.75 
 
 
444 aa  70.5  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  28.75 
 
 
442 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  27.22 
 
 
727 aa  67  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  23.46 
 
 
513 aa  65.5  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  42 
 
 
7149 aa  65.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  27.02 
 
 
2127 aa  65.1  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1710  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.91 
 
 
399 aa  62.4  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  31.9 
 
 
894 aa  61.6  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  28.21 
 
 
4013 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  31.15 
 
 
1053 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.4 
 
 
547 aa  60.8  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  34.03 
 
 
1031 aa  60.1  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  29.39 
 
 
5171 aa  57  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.67 
 
 
615 aa  55.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  34.31 
 
 
750 aa  55.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  35.56 
 
 
932 aa  53.9  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0736  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.28 
 
 
1021 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.95 
 
 
913 aa  52.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  35.4 
 
 
1350 aa  52  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  35.4 
 
 
1806 aa  51.6  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  27.65 
 
 
820 aa  50.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0174  hypothetical protein  31.31 
 
 
438 aa  50.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.023441  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  29.48 
 
 
681 aa  50.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  30.57 
 
 
16311 aa  49.3  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  29.08 
 
 
614 aa  48.9  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4932  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.62 
 
 
520 aa  48.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.908823  normal  0.398469 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1308  hypothetical protein  32.99 
 
 
414 aa  48.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1222  hypothetical protein  32.18 
 
 
392 aa  47.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.111374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3239  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.85 
 
 
1535 aa  47.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.43 
 
 
2281 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  27.05 
 
 
451 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4726  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.03 
 
 
826 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20971  hypothetical protein  40 
 
 
393 aa  45.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.468089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  28.72 
 
 
1418 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  28.26 
 
 
531 aa  45.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  33.04 
 
 
1222 aa  44.3  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>