155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3936 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.16 
 
 		 1012 aa  743    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.28 
 
 		 1118 aa  729    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.05 
 
 		 1113 aa  721    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  59 
 
 		 891 aa  843    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.25 
 
 		 1340 aa  665    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.02 
 
 		 889 aa  702    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 1009 aa  2007    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.62 
 
 		 1222 aa  697    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.86 
 
 		 1225 aa  701    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.32 
 
 		 2194 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  40.53 
 
 		 1019 aa  280  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  46.33 
 
 		 1037 aa  261  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  42.03 
 
 		 386 aa  220  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  40.19 
 
 		 412 aa  204  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.79 
 
 		 928 aa  201  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.91 
 
 		 1800 aa  195  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  45.41 
 
 		 2305 aa  191  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  33.72 
 
 		 828 aa  189  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  32.9 
 
 		 1557 aa  183  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  41.92 
 
 		 2310 aa  178  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39 
 
 		 1269 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  38.44 
 
 		 1838 aa  173  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  34 
 
 		 2807 aa  173  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39 
 
 		 1269 aa  173  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  33.88 
 
 		 644 aa  170  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.22 
 
 		 768 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  34.25 
 
 		 813 aa  167  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.43 
 
 		 1661 aa  162  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  32.57 
 
 		 872 aa  163  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  32.62 
 
 		 1029 aa  161  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.62 
 
 		 1029 aa  161  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  33.89 
 
 		 554 aa  157  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  24.42 
 
 		 4379 aa  151  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  36.33 
 
 		 1490 aa  146  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  35.07 
 
 		 1126 aa  142  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  27.77 
 
 		 1289 aa  138  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  33.33 
 
 		 662 aa  122  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  38.6 
 
 		 1275 aa  120  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  33.52 
 
 		 974 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  32.76 
 
 		 604 aa  118  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  29.17 
 
 		 616 aa  113  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.97 
 
 		 1415 aa  113  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  27.37 
 
 		 5899 aa  112  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.37 
 
 		 3168 aa  108  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  30 
 
 		 657 aa  105  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  35.79 
 
 		 663 aa  101  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  28.69 
 
 		 685 aa  97.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  28.57 
 
 		 472 aa  95.9  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.34 
 
 		 1180 aa  95.1  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  28.72 
 
 		 485 aa  95.1  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3672  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.29 
 
 		 255 aa  94.7  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.37 
 
 		 3396 aa  92.8  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  31.51 
 
 		 5444 aa  89  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2106  hypothetical protein  33.74 
 
 		 1058 aa  88.2  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.866139  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  48.45 
 
 		 1594 aa  88.2  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  48.45 
 
 		 1156 aa  87.4  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  27.22 
 
 		 494 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  29.66 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  33.08 
 
 		 3197 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  34.27 
 
 		 7149 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  45.28 
 
 		 863 aa  84.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  30.51 
 
 		 1022 aa  78.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  31.45 
 
 		 3197 aa  78.6  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  27.91 
 
 		 2127 aa  78.6  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.19 
 
 		 647 aa  78.2  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  24.05 
 
 		 8871 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  28.27 
 
 		 4013 aa  75.5  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  33.87 
 
 		 720 aa  75.5  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  31.38 
 
 		 1124 aa  74.7  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.5 
 
 		 547 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1127 aa  72.8  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  31.61 
 
 		 837 aa  71.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  39.45 
 
 		 161 aa  71.2  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  38.95 
 
 		 2334 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  35.19 
 
 		 2796 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  42.59 
 
 		 2632 aa  70.1  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  29.17 
 
 		 917 aa  67.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  38.33 
 
 		 16311 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  33.64 
 
 		 894 aa  67  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.03 
 
 		 1092 aa  67  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.14 
 
 		 11716 aa  65.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  35.14 
 
 		 715 aa  65.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.79 
 
 		 5098 aa  64.7  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  29.65 
 
 		 447 aa  64.3  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0736  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.8 
 
 		 1021 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.86 
 
 		 1091 aa  62.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  31.78 
 
 		 894 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  25.37 
 
 		 1031 aa  62  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1210 aa  62  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29131  hypothetical protein  33.33 
 
 		 934 aa  61.6  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1636  peptidase  36.28 
 
 		 800 aa  60.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5616  hypothetical protein  35.44 
 
 		 427 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1710  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.96 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.88 
 
 		 615 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  37.86 
 
 		 663 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  31.03 
 
 		 1053 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  26.56 
 
 		 2885 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4122  hypothetical protein  25.95 
 
 		 508 aa  57  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  30.37 
 
 		 517 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  28.36 
 
 		 456 aa  55.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>