37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1710 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1710  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 399 aa  804    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.15 
 
 		 588 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  34.81 
 
 		 2310 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.91 
 
 		 768 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  35.96 
 
 		 1037 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  38.37 
 
 		 2305 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.96 
 
 		 1009 aa  59.7  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.71 
 
 		 1118 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.71 
 
 		 1113 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.53 
 
 		 1269 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.51 
 
 		 891 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.54 
 
 		 1661 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.67 
 
 		 3168 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.82 
 
 		 1012 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.29 
 
 		 1180 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.76 
 
 		 1340 aa  53.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40 
 
 		 1029 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  40 
 
 		 1029 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.16 
 
 		 1269 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2275  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.09 
 
 		 288 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.4 
 
 		 889 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.76 
 
 		 2194 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.71 
 
 		 1800 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.07 
 
 		 1225 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.07 
 
 		 1222 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2189  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  23.97 
 
 		 261 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3247  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.11 
 
 		 262 aa  50.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  44.64 
 
 		 8871 aa  49.7  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.81 
 
 		 928 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0174  hypothetical protein  32.93 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.023441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.37 
 
 		 615 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  36.59 
 
 		 2796 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  37.68 
 
 		 7149 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  34.12 
 
 		 1053 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1788  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.86 
 
 		 226 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1839  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.89 
 
 		 280 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.841987  normal  0.233297 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2036  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.87 
 
 		 278 aa  43.5  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>