44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_1842 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  320  6e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50.44 
 
 
1222 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.56 
 
 
1118 aa  90.1  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.79 
 
 
1225 aa  87.4  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.67 
 
 
1340 aa  86.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  48.67 
 
 
1019 aa  86.3  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.79 
 
 
1113 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.04 
 
 
2194 aa  81.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.12 
 
 
889 aa  79.7  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.25 
 
 
1012 aa  75.1  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.45 
 
 
1009 aa  71.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  44.55 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.8 
 
 
891 aa  67.4  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  38.52 
 
 
1838 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  46.24 
 
 
828 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  34.26 
 
 
412 aa  60.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  39.39 
 
 
1557 aa  60.8  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  39.18 
 
 
1126 aa  58.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  33.64 
 
 
554 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  43.84 
 
 
662 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  37.04 
 
 
872 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  38.89 
 
 
1275 aa  52  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
1127 aa  51.2  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  41 
 
 
604 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  35.71 
 
 
813 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  44.16 
 
 
616 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  37.04 
 
 
2807 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  34.82 
 
 
1490 aa  48.5  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  34.02 
 
 
1289 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  35.65 
 
 
644 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.04 
 
 
737 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.36 
 
 
11716 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  33.33 
 
 
4379 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  37.96 
 
 
657 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  36.46 
 
 
685 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  38.46 
 
 
3197 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  36.36 
 
 
663 aa  44.3  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  29.09 
 
 
837 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30 
 
 
1236 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4648  hypothetical protein  43.94 
 
 
110 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  32.69 
 
 
472 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  32.58 
 
 
3197 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  32.38 
 
 
1638 aa  40.8  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.7 
 
 
1138 aa  40.8  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>