123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1814 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 
554 aa  1098    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  34.75 
 
 
872 aa  239  9e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  35.66 
 
 
1019 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.65 
 
 
1222 aa  194  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.49 
 
 
1340 aa  192  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.31 
 
 
1118 aa  186  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.31 
 
 
2807 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.2 
 
 
889 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 
1012 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  34.49 
 
 
1838 aa  176  8e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.97 
 
 
2194 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  32.98 
 
 
4379 aa  172  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.57 
 
 
1113 aa  170  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.44 
 
 
1009 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.04 
 
 
1225 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  32.95 
 
 
1557 aa  167  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  31.68 
 
 
412 aa  146  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.93 
 
 
891 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  28.73 
 
 
828 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  30.95 
 
 
1490 aa  127  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  31.43 
 
 
644 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  30.79 
 
 
1126 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  30.26 
 
 
1289 aa  120  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  32 
 
 
813 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  29.94 
 
 
386 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.19 
 
 
1275 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  27.78 
 
 
974 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  27.34 
 
 
616 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  32.98 
 
 
662 aa  100  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  25.73 
 
 
472 aa  90.5  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  29.11 
 
 
1124 aa  88.6  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  28.34 
 
 
604 aa  88.6  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  26.45 
 
 
469 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  27.27 
 
 
494 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  32.82 
 
 
659 aa  77.4  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  26.69 
 
 
447 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  28.95 
 
 
3197 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1205  hypothetical protein  32.06 
 
 
537 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  28.43 
 
 
3197 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
1127 aa  74.3  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  31.58 
 
 
676 aa  73.9  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0646  hypothetical protein  28.64 
 
 
521 aa  73.9  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  26.44 
 
 
685 aa  71.2  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  30.87 
 
 
663 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.41 
 
 
684 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  31.43 
 
 
485 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2251  hypothetical protein  32.82 
 
 
887 aa  68.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00410803  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  23.22 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  25.74 
 
 
593 aa  67.8  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  27.7 
 
 
657 aa  67.4  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  24.49 
 
 
437 aa  65.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  32.28 
 
 
645 aa  64.7  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  24.32 
 
 
917 aa  64.3  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  27.47 
 
 
1638 aa  63.9  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.3 
 
 
959 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  26.12 
 
 
456 aa  62.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  30.14 
 
 
1022 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.22 
 
 
11716 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.97 
 
 
635 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  28.4 
 
 
837 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  27.63 
 
 
466 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  25.2 
 
 
655 aa  57.4  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
621 aa  57.4  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  26.41 
 
 
562 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4648  hypothetical protein  47.22 
 
 
110 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  23.91 
 
 
433 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  33.64 
 
 
161 aa  55.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  29.61 
 
 
658 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.83 
 
 
1226 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  25.1 
 
 
524 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  28.05 
 
 
470 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  28.57 
 
 
404 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  25.61 
 
 
1127 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  25.2 
 
 
499 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  26.35 
 
 
1575 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  30.25 
 
 
720 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  25.69 
 
 
1088 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  27.4 
 
 
604 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.72 
 
 
1170 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  23.27 
 
 
1109 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.61 
 
 
1192 aa  50.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.1 
 
 
600 aa  50.4  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.97 
 
 
1208 aa  50.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  23.81 
 
 
1126 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  25.47 
 
 
2417 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  25.47 
 
 
2458 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4122  hypothetical protein  23.27 
 
 
508 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  25.14 
 
 
803 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  27.94 
 
 
517 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  25.09 
 
 
1098 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 
1372 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  32.82 
 
 
1113 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.65 
 
 
1228 aa  48.9  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  25.12 
 
 
523 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  26.15 
 
 
8871 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  25.3 
 
 
883 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  24.47 
 
 
569 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.15 
 
 
1114 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.64 
 
 
737 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  30.35 
 
 
510 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>