25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1892 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  100 
 
 
863 aa  1727    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  37.68 
 
 
1156 aa  456  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  37.8 
 
 
1594 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  36.61 
 
 
2632 aa  369  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  39.79 
 
 
2334 aa  297  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  36.36 
 
 
715 aa  207  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1636  peptidase  28.04 
 
 
800 aa  202  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25.23 
 
 
3193 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  33.33 
 
 
2062 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4303  peptidase-like  27.42 
 
 
1289 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0594037  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.4 
 
 
891 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.28 
 
 
1009 aa  84.7  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  27.54 
 
 
995 aa  82  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.61 
 
 
1225 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  39.23 
 
 
663 aa  76.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.11 
 
 
1118 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.32 
 
 
1113 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.78 
 
 
1012 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.46 
 
 
1222 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.82 
 
 
2194 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1886  peptidase  24.43 
 
 
827 aa  65.1  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.94 
 
 
1340 aa  64.7  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1649  peptidase-like  41.35 
 
 
167 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.165499  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3082  peptidase domain protein  21.03 
 
 
539 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0783  peptidase-like  25 
 
 
451 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.888288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>