44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3082 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3082  peptidase domain protein  100 
 
 		 539 aa  1078    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  28.79 
 
 		 495 aa  93.6  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  26.04 
 
 		 2632 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  23.64 
 
 		 1156 aa  77  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  23.33 
 
 		 1594 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  24.92 
 
 		 715 aa  74.7  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  30.69 
 
 		 2402 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.56 
 
 		 3193 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  24.92 
 
 		 2334 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  32.78 
 
 		 3923 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  28.09 
 
 		 3562 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1636  peptidase  23.26 
 
 		 800 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.64 
 
 		 3552 aa  63.9  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  29.23 
 
 		 5451 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.18 
 
 		 4106 aa  60.5  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3434  metallophosphoesterase  37.17 
 
 		 1327 aa  60.5  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  32.74 
 
 		 8064 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  24.76 
 
 		 2062 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  31.74 
 
 		 6310 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  30.8 
 
 		 2456 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  36.79 
 
 		 3586 aa  57  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  31 
 
 		 2625 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  27.82 
 
 		 1104 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1278 aa  55.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  25.66 
 
 		 3824 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  28.51 
 
 		 1104 aa  53.9  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  21.03 
 
 		 863 aa  53.5  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4303  peptidase-like  22.41 
 
 		 1289 aa  53.5  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0594037  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0284  hypothetical protein  29.3 
 
 		 347 aa  53.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000141879  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  30.32 
 
 		 3721 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  29.53 
 
 		 3739 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  32.23 
 
 		 2704 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  39.47 
 
 		 3824 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  39.47 
 
 		 3824 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  33.91 
 
 		 4430 aa  47.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  32.61 
 
 		 3325 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0232  hypothetical protein  28.09 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4418  hypothetical protein  33.13 
 
 		 1207 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.535259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1448  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1019 aa  45.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  32.69 
 
 		 5559 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  32.69 
 
 		 5561 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  32.69 
 
 		 5561 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  32.69 
 
 		 5561 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  32.69 
 
 		 5559 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>