64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2814 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  100 
 
 
2334 aa  4590    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  49.69 
 
 
2632 aa  610  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  35.2 
 
 
1156 aa  325  7e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  39.79 
 
 
863 aa  323  3e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  35.21 
 
 
1594 aa  315  6.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  35 
 
 
715 aa  209  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1636  peptidase  30.8 
 
 
800 aa  197  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  26.22 
 
 
4231 aa  179  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  28.74 
 
 
4848 aa  159  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  24.95 
 
 
4465 aa  152  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4303  peptidase-like  35.76 
 
 
1289 aa  140  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0594037  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25.47 
 
 
3193 aa  135  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.78 
 
 
11716 aa  135  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  35.71 
 
 
2062 aa  117  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  28.05 
 
 
5745 aa  105  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.68 
 
 
4836 aa  102  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  29.25 
 
 
4978 aa  96.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  32.24 
 
 
995 aa  91.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  23.88 
 
 
2853 aa  86.7  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  29.48 
 
 
2816 aa  86.3  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  26.24 
 
 
8321 aa  81.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3082  peptidase domain protein  24.92 
 
 
539 aa  77.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.18 
 
 
1009 aa  78.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.81 
 
 
1113 aa  76.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.02 
 
 
1012 aa  74.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.24 
 
 
4122 aa  74.7  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.31 
 
 
1222 aa  73.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  25.05 
 
 
2820 aa  72.8  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.95 
 
 
1225 aa  72.8  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  29.18 
 
 
5442 aa  72.4  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.73 
 
 
2194 aa  72.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  30.74 
 
 
2768 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  30.25 
 
 
814 aa  71.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1886  peptidase  26.26 
 
 
827 aa  71.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.43 
 
 
1118 aa  71.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.96 
 
 
1340 aa  71.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  33.67 
 
 
663 aa  68.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.17 
 
 
891 aa  67  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  27.66 
 
 
4791 aa  65.9  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.04 
 
 
5839 aa  62.8  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  24.32 
 
 
3598 aa  61.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.82 
 
 
4220 aa  60.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  25.95 
 
 
2074 aa  60.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  26.22 
 
 
5094 aa  59.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  27.1 
 
 
2701 aa  59.7  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1649  peptidase-like  43.9 
 
 
167 aa  57.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.165499  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  35.35 
 
 
1315 aa  54.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  31.77 
 
 
3927 aa  53.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  28.12 
 
 
3544 aa  53.5  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1197  peptidase domain protein  34.38 
 
 
155 aa  52.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1170  peptidase domain protein  34.38 
 
 
155 aa  52.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  26.44 
 
 
6211 aa  52.8  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.6 
 
 
3363 aa  52.8  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3224  peptidase domain protein  36.46 
 
 
149 aa  52.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787939 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  24 
 
 
495 aa  50.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  25.95 
 
 
1428 aa  49.7  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  24.66 
 
 
2767 aa  48.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0741  peptidase domain-containing protein  34.02 
 
 
158 aa  48.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  28.46 
 
 
6779 aa  48.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  28.46 
 
 
6662 aa  48.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.46 
 
 
6683 aa  48.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
1199 aa  48.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3710  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.7 
 
 
394 aa  47  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  28.81 
 
 
2522 aa  46.2  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>