21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1886 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1886  peptidase  100 
 
 
827 aa  1655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1636  peptidase  28.57 
 
 
800 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5424  hypothetical protein  29.97 
 
 
567 aa  102  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.328963 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  29.23 
 
 
2632 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3448  peptidase C2 calpain  29.41 
 
 
360 aa  82  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0447153  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  25.45 
 
 
1594 aa  81.6  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4303  peptidase-like  23.22 
 
 
1289 aa  81.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0594037  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  24.91 
 
 
1156 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2853  peptidase C2 calpain  29.2 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0973219  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  37.93 
 
 
2062 aa  72  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  25.52 
 
 
715 aa  70.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  24.36 
 
 
863 aa  68.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  25.68 
 
 
2334 aa  68.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25.92 
 
 
3193 aa  61.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  33.61 
 
 
995 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1300  peptidase C2 calpain  27.19 
 
 
384 aa  52  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.58 
 
 
891 aa  51.2  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00256  Calpain-like protease palB (EC 3.4.22.-)(Cysteine protease palB) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00204]  24.88 
 
 
847 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0894791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.78 
 
 
1009 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0117  peptidase C2 calpain  27.62 
 
 
598 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.76 
 
 
1113 aa  45.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>