169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2094 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 1428 aa  2726    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.8 
 
 		 1884 aa  249  4e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  35.14 
 
 		 4978 aa  210  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  35.94 
 
 		 6211 aa  205  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  30.91 
 
 		 3191 aa  200  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  34.93 
 
 		 4848 aa  199  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  35.65 
 
 		 2767 aa  191  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  36.32 
 
 		 2353 aa  190  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  33.73 
 
 		 1597 aa  190  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  32.15 
 
 		 5745 aa  175  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  31.24 
 
 		 2555 aa  161  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  29.63 
 
 		 9867 aa  158  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  44.1 
 
 		 5094 aa  157  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  33.87 
 
 		 2074 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  44.27 
 
 		 1699 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.6 
 
 		 3363 aa  149  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  30.7 
 
 		 8321 aa  148  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  30.23 
 
 		 2839 aa  148  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  31.28 
 
 		 6678 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.27 
 
 		 2114 aa  126  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.37 
 
 		 4122 aa  126  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  33.83 
 
 		 2816 aa  125  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  29.45 
 
 		 2807 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  32.44 
 
 		 1269 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.88 
 
 		 2812 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  39.76 
 
 		 2924 aa  120  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  33.94 
 
 		 1269 aa  117  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  31.09 
 
 		 721 aa  116  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  31.47 
 
 		 2853 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.49 
 
 		 4836 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  33.55 
 
 		 1268 aa  111  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  28.27 
 
 		 814 aa  111  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  28.63 
 
 		 1706 aa  109  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  33 
 
 		 3477 aa  109  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  29.84 
 
 		 3474 aa  108  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  31.25 
 
 		 1867 aa  108  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  28.74 
 
 		 3758 aa  108  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  30.9 
 
 		 3927 aa  105  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  35.27 
 
 		 1143 aa  102  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.53 
 
 		 4220 aa  102  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.91 
 
 		 3816 aa  102  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  29.38 
 
 		 4854 aa  101  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  32.01 
 
 		 4791 aa  100  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  34.35 
 
 		 1598 aa  99.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  27.59 
 
 		 2820 aa  96.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.83 
 
 		 994 aa  96.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.06 
 
 		 5839 aa  96.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  35.03 
 
 		 2768 aa  95.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  30.94 
 
 		 5442 aa  94.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  30.05 
 
 		 5769 aa  94  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  26.53 
 
 		 16311 aa  92.8  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.41 
 
 		 5787 aa  92.8  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  31.45 
 
 		 892 aa  92.8  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  40.79 
 
 		 1350 aa  91.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.14 
 
 		 850 aa  87.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  26.79 
 
 		 1141 aa  86.7  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  33.14 
 
 		 4285 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  30.85 
 
 		 2567 aa  86.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  25.49 
 
 		 7284 aa  85.9  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  27.74 
 
 		 16322 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.47 
 
 		 2507 aa  83.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  30.71 
 
 		 2377 aa  84  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.21 
 
 		 11716 aa  83.2  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1512 aa  82.8  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  31 
 
 		 5218 aa  82.4  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  41.3 
 
 		 1166 aa  81.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  30.3 
 
 		 3089 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.99 
 
 		 3699 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  35.46 
 
 		 5123 aa  78.6  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  29.78 
 
 		 1750 aa  78.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  39.86 
 
 		 912 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.94 
 
 		 5962 aa  76.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  30.47 
 
 		 6662 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  30.47 
 
 		 6779 aa  76.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.47 
 
 		 6683 aa  76.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.2 
 
 		 1599 aa  75.5  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  29.21 
 
 		 1215 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  29.02 
 
 		 1215 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.21 
 
 		 1215 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  30.88 
 
 		 3699 aa  74.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  39.46 
 
 		 5171 aa  73.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  28.87 
 
 		 1215 aa  72.8  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  29.68 
 
 		 3544 aa  73.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 2836 aa  72.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  28.87 
 
 		 1215 aa  72.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  32.74 
 
 		 2503 aa  72.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.56 
 
 		 761 aa  72  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  27.94 
 
 		 2001 aa  70.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.22 
 
 		 1066 aa  70.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1538 aa  69.7  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  29.78 
 
 		 1883 aa  68.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.99 
 
 		 1109 aa  68.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  28.47 
 
 		 4231 aa  68.6  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1416 aa  68.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.6 
 
 		 2239 aa  67.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  27.46 
 
 		 2743 aa  67.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  38.46 
 
 		 542 aa  64.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  38.28 
 
 		 4214 aa  63.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  28.96 
 
 		 2193 aa  63.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  34.51 
 
 		 3314 aa  62.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>