186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0470 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  100 
 
 		 2853 aa  5497    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  45.87 
 
 		 3699 aa  692    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  62.8 
 
 		 2001 aa  696    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  43.45 
 
 		 4465 aa  947    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.22 
 
 		 3699 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  54.32 
 
 		 4231 aa  1224    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  78.28 
 
 		 2820 aa  4172    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.34 
 
 		 11716 aa  922    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  41.6 
 
 		 3544 aa  720    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  46.02 
 
 		 3598 aa  521  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  54.01 
 
 		 2132 aa  365  9e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  34.26 
 
 		 3474 aa  347  2.9999999999999997e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  37.16 
 
 		 3244 aa  323  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  36.31 
 
 		 2079 aa  322  6e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  32.64 
 
 		 2522 aa  249  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  31.29 
 
 		 1779 aa  233  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  29.56 
 
 		 2402 aa  219  7e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  46.46 
 
 		 3391 aa  215  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  30.48 
 
 		 2839 aa  209  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  52.04 
 
 		 2701 aa  194  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  29.4 
 
 		 2656 aa  192  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  29.94 
 
 		 5020 aa  186  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  38.53 
 
 		 2233 aa  175  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  50.65 
 
 		 8871 aa  170  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.28 
 
 		 1884 aa  167  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  35.71 
 
 		 3132 aa  158  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  45.59 
 
 		 2954 aa  155  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  28.89 
 
 		 3191 aa  155  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  35.55 
 
 		 1728 aa  145  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  47.02 
 
 		 16311 aa  140  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  26.28 
 
 		 3563 aa  140  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  37.28 
 
 		 2337 aa  140  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  30.2 
 
 		 3066 aa  134  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  36.74 
 
 		 6678 aa  133  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  43.71 
 
 		 1838 aa  133  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  34.23 
 
 		 683 aa  130  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.08 
 
 		 3363 aa  130  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  34.7 
 
 		 2503 aa  129  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.99 
 
 		 5787 aa  128  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  33.69 
 
 		 3927 aa  127  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  42.86 
 
 		 2461 aa  127  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  39.47 
 
 		 2133 aa  125  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.54 
 
 		 14916 aa  122  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 3954 aa  122  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  28.7 
 
 		 4978 aa  120  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  27.38 
 
 		 9867 aa  119  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3550  Dystroglycan-type cadherin domain protein  31.4 
 
 		 962 aa  119  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  37.06 
 
 		 1019 aa  118  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  36.04 
 
 		 12741 aa  116  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  43.55 
 
 		 3477 aa  115  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  43.81 
 
 		 2476 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  29.9 
 
 		 1428 aa  114  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  30.16 
 
 		 5094 aa  114  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  42.18 
 
 		 1855 aa  113  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  37.95 
 
 		 337 aa  113  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  41.03 
 
 		 8980 aa  112  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  31.14 
 
 		 5745 aa  111  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  50.39 
 
 		 1055 aa  110  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  28.49 
 
 		 1631 aa  110  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  38.66 
 
 		 4334 aa  109  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  39.52 
 
 		 938 aa  108  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  38.51 
 
 		 2802 aa  108  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.35 
 
 		 3427 aa  108  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  28.92 
 
 		 1867 aa  107  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  28.43 
 
 		 4848 aa  107  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  50.41 
 
 		 2182 aa  107  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  26.43 
 
 		 3439 aa  107  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  38.55 
 
 		 940 aa  105  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  39.04 
 
 		 824 aa  104  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  28.38 
 
 		 3508 aa  103  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  25.5 
 
 		 8321 aa  103  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  46.23 
 
 		 3209 aa  103  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  31.01 
 
 		 2127 aa  102  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  45.67 
 
 		 1610 aa  100  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  43.8 
 
 		 5769 aa  100  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  38.26 
 
 		 922 aa  98.2  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.41 
 
 		 2507 aa  98.2  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  25.71 
 
 		 4285 aa  95.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  31.34 
 
 		 2636 aa  94.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  34.78 
 
 		 731 aa  94.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  34.29 
 
 		 3714 aa  93.2  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  45.13 
 
 		 1610 aa  90.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  27.87 
 
 		 2555 aa  90.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  41.06 
 
 		 492 aa  90.1  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  36.09 
 
 		 3026 aa  90.5  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  29.45 
 
 		 3089 aa  89.7  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  27.95 
 
 		 1022 aa  86.7  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  32.79 
 
 		 917 aa  86.7  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  25.09 
 
 		 4661 aa  86.7  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  26.52 
 
 		 2377 aa  86.7  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  30.94 
 
 		 426 aa  84.7  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.08 
 
 		 994 aa  84.7  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  45.95 
 
 		 1342 aa  84.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  28.23 
 
 		 1017 aa  84  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  28.09 
 
 		 3542 aa  82.4  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  33.96 
 
 		 3193 aa  80.9  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  33.72 
 
 		 1421 aa  80.9  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1512 aa  80.1  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  23.9 
 
 		 2334 aa  79.7  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1002 aa  79.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>