118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1637 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1637  VCBS  100 
 
 		 2127 aa  4142    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  36.76 
 
 		 5094 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  38.18 
 
 		 2567 aa  377  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  34.52 
 
 		 5020 aa  374  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.36 
 
 		 2812 aa  314  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  33.81 
 
 		 4854 aa  307  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  32.71 
 
 		 2743 aa  282  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  31.02 
 
 		 16311 aa  251  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  33.83 
 
 		 3229 aa  251  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  32.95 
 
 		 3439 aa  248  8e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  39.05 
 
 		 1141 aa  247  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  32.29 
 
 		 1883 aa  246  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  32.49 
 
 		 6678 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  30.77 
 
 		 4285 aa  237  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  34.16 
 
 		 3758 aa  236  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.93 
 
 		 2239 aa  231  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  30.98 
 
 		 3259 aa  226  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.45 
 
 		 2067 aa  225  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  29.51 
 
 		 4661 aa  224  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.15 
 
 		 1553 aa  213  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.04 
 
 		 14916 aa  207  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  29.92 
 
 		 2784 aa  188  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  38.12 
 
 		 1206 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  28.98 
 
 		 8321 aa  148  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.59 
 
 		 8871 aa  147  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  41.11 
 
 		 5769 aa  141  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  29.33 
 
 		 7284 aa  133  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.8 
 
 		 1599 aa  122  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  28.13 
 
 		 3182 aa  122  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  34.04 
 
 		 2060 aa  120  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.04 
 
 		 2678 aa  120  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.85 
 
 		 1884 aa  119  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  26.25 
 
 		 2555 aa  115  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  28.18 
 
 		 2461 aa  112  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.91 
 
 		 1963 aa  112  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  31.5 
 
 		 2001 aa  110  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  33.08 
 
 		 4231 aa  106  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  31.19 
 
 		 2853 aa  102  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  28.2 
 
 		 3474 aa  99.4  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  35.02 
 
 		 2820 aa  94.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.93 
 
 		 11716 aa  92  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  26.51 
 
 		 3714 aa  90.1  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  27.24 
 
 		 3508 aa  88.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  26.07 
 
 		 3091 aa  87.4  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  35.37 
 
 		 4465 aa  86.7  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  26.44 
 
 		 2074 aa  86.7  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  46.36 
 
 		 1055 aa  84  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  27.4 
 
 		 3191 aa  84  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  32.64 
 
 		 3598 aa  84.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  37.56 
 
 		 2039 aa  83.2  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  41.32 
 
 		 5218 aa  80.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  47.87 
 
 		 1019 aa  78.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  25.97 
 
 		 4978 aa  78.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  43.93 
 
 		 1757 aa  78.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  26.79 
 
 		 5745 aa  78.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  34.73 
 
 		 2337 aa  77  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  31.34 
 
 		 3026 aa  75.9  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  39.13 
 
 		 2701 aa  75.1  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  35.51 
 
 		 1728 aa  74.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  26.84 
 
 		 3927 aa  73.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  26.57 
 
 		 3699 aa  73.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.51 
 
 		 2507 aa  72.4  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  30.87 
 
 		 991 aa  72.4  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.77 
 
 		 994 aa  72  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  36.24 
 
 		 3391 aa  72.4  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.5 
 
 		 5962 aa  71.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  26.96 
 
 		 3132 aa  70.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.19 
 
 		 3699 aa  70.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  31.51 
 
 		 998 aa  69.7  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  37.17 
 
 		 3209 aa  69.3  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.36 
 
 		 850 aa  68.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  30.52 
 
 		 2132 aa  68.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  33.77 
 
 		 2954 aa  68.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.56 
 
 		 3363 aa  67.4  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  25.39 
 
 		 3544 aa  63.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.96 
 
 		 5098 aa  63.2  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  24.83 
 
 		 2887 aa  62.8  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  35.62 
 
 		 8682 aa  62  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  35.62 
 
 		 9030 aa  62.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  30.64 
 
 		 2503 aa  61.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  37.98 
 
 		 2377 aa  60.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  35 
 
 		 6753 aa  59.7  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  27.06 
 
 		 3089 aa  59.3  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  30.23 
 
 		 2522 aa  58.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  30.06 
 
 		 1428 aa  58.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.52 
 
 		 2807 aa  57.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  38.89 
 
 		 1610 aa  57.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  29.92 
 
 		 1610 aa  57  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  30.15 
 
 		 3477 aa  56.6  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  30.8 
 
 		 2476 aa  56.2  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  40 
 
 		 1598 aa  55.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  31.16 
 
 		 6211 aa  54.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  26.7 
 
 		 1597 aa  53.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  30.12 
 
 		 2839 aa  53.9  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  40.79 
 
 		 2182 aa  53.1  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  27.27 
 
 		 2145 aa  52.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  29.64 
 
 		 2816 aa  52.8  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  38.62 
 
 		 2836 aa  52.8  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  28.38 
 
 		 1631 aa  51.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1512 aa  52  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>