82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7154 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  100 
 
 		 2039 aa  3985    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  26.96 
 
 		 16311 aa  142  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  33.87 
 
 		 8871 aa  137  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  34.64 
 
 		 6678 aa  136  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  36.74 
 
 		 3132 aa  120  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  28.48 
 
 		 3259 aa  102  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.58 
 
 		 1963 aa  92.4  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  27.61 
 
 		 2461 aa  86.7  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  34.92 
 
 		 2567 aa  84.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  30.45 
 
 		 3229 aa  83.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  37.56 
 
 		 2127 aa  83.2  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  26.3 
 
 		 4661 aa  82.8  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.91 
 
 		 1553 aa  82.4  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.61 
 
 		 2507 aa  82.4  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  35.98 
 
 		 1206 aa  81.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  31.3 
 
 		 147 aa  79  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  34.34 
 
 		 4285 aa  76.3  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5663  hypothetical protein  46.91 
 
 		 846 aa  74.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198442  normal  0.529152 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  36.89 
 
 		 235 aa  74.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5612  hypothetical protein  46.84 
 
 		 809 aa  73.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352581  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  42.11 
 
 		 1792 aa  72.4  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0770  hypothetical protein  49.38 
 
 		 953 aa  72.4  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1025  hypothetical protein  40.35 
 
 		 239 aa  71.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0398824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.99 
 
 		 2067 aa  69.7  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  31.2 
 
 		 143 aa  69.3  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  35.56 
 
 		 335 aa  69.3  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3387  hypothetical protein  38.58 
 
 		 253 aa  63.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  28.79 
 
 		 800 aa  62.8  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6493  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 1102 aa  61.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  28.68 
 
 		 576 aa  60.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  29.97 
 
 		 4120 aa  60.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  30.45 
 
 		 1883 aa  60.1  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  28.92 
 
 		 2784 aa  59.7  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  34.91 
 
 		 1278 aa  59.3  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  27.56 
 
 		 573 aa  59.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2671  protein of unknown function DUF1555  39.56 
 
 		 230 aa  58.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.985757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1564  protein of unknown function DUF1555  39.56 
 
 		 230 aa  58.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1675  hypothetical protein  38.36 
 
 		 296 aa  57.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  28.97 
 
 		 581 aa  57.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  21.66 
 
 		 11716 aa  57  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  28.45 
 
 		 542 aa  57.4  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.96 
 
 		 5098 aa  56.2  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  27.68 
 
 		 602 aa  56.2  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1810  hypothetical protein  23.91 
 
 		 556 aa  56.2  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1203  hypothetical protein  45.78 
 
 		 278 aa  55.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  32.28 
 
 		 3439 aa  55.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0634  hypothetical protein  30.58 
 
 		 146 aa  55.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000800273  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  26.52 
 
 		 5020 aa  55.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.84 
 
 		 2239 aa  55.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0927  hypothetical protein  31.06 
 
 		 1248 aa  55.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0959972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  28.68 
 
 		 376 aa  54.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  31.65 
 
 		 1838 aa  55.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  55.77 
 
 		 5094 aa  53.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  26.15 
 
 		 143 aa  53.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  26.02 
 
 		 3182 aa  54.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  28.99 
 
 		 153 aa  53.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  32.69 
 
 		 907 aa  53.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0788  hypothetical protein  40.23 
 
 		 280 aa  52  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0115526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  27.87 
 
 		 2454 aa  52  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  31.22 
 
 		 3758 aa  52  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.7 
 
 		 1599 aa  51.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0789  hypothetical protein  37.5 
 
 		 280 aa  51.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000257398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  31.89 
 
 		 2555 aa  51.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1405  hypothetical protein  28.79 
 
 		 155 aa  50.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  28.9 
 
 		 8321 aa  50.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2346  hypothetical protein  27.5 
 
 		 300 aa  50.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  32.28 
 
 		 3736 aa  50.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1851  hypothetical protein  25.77 
 
 		 312 aa  49.3  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  30.19 
 
 		 3091 aa  49.3  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  31.65 
 
 		 3734 aa  49.3  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  27.69 
 
 		 3714 aa  48.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3718  hypothetical protein  27.78 
 
 		 154 aa  47  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.98166  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  30.39 
 
 		 2060 aa  47.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.5 
 
 		 2678 aa  47.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  28.86 
 
 		 3508 aa  47  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  31.31 
 
 		 202 aa  47  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1706  hypothetical protein  28.71 
 
 		 262 aa  47  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  31.31 
 
 		 202 aa  47  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1705  hypothetical protein  27.72 
 
 		 259 aa  46.6  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  31.25 
 
 		 4854 aa  46.2  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.95 
 
 		 3796 aa  46.2  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  28.95 
 
 		 352 aa  45.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>