25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1675 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1675  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  587  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642671  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  41.18 
 
 
335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  35.77 
 
 
581 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  39 
 
 
576 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  33.33 
 
 
573 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1810  hypothetical protein  33.82 
 
 
556 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  33.04 
 
 
602 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  34.13 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2346  hypothetical protein  33.59 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  28.12 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  31.9 
 
 
333 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1762  hypothetical protein  29.67 
 
 
294 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426629  normal  0.0904839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  33.68 
 
 
2039 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  38.1 
 
 
542 aa  56.2  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1852  hypothetical protein  33.02 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.428196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  29.79 
 
 
153 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  28.72 
 
 
800 aa  49.3  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1851  hypothetical protein  27.45 
 
 
312 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  29.7 
 
 
143 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  26.8 
 
 
410 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  25.71 
 
 
147 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  25 
 
 
376 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.08 
 
 
2507 aa  42.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  25.12 
 
 
1237 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  25.29 
 
 
143 aa  42.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>