26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0304 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  100 
 
 		 542 aa  1068    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  36.57 
 
 		 2454 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  46.15 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  37.8 
 
 		 573 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  35.16 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  33.33 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1113  hypothetical protein  33.33 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  26.57 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  28.45 
 
 		 2039 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  34.15 
 
 		 576 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  34.15 
 
 		 581 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  32.98 
 
 		 602 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1675  hypothetical protein  38.1 
 
 		 296 aa  56.2  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  30.51 
 
 		 147 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0927  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1248 aa  55.1  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0959972  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1810  hypothetical protein  26.35 
 
 		 556 aa  54.3  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  24 
 
 		 290 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1762  hypothetical protein  29.5 
 
 		 294 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426629  normal  0.0904839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1970  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  47.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000904058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  22.93 
 
 		 800 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  23.74 
 
 		 153 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1324  hypothetical protein  27.84 
 
 		 231 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.311232  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  28.33 
 
 		 352 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  28.33 
 
 		 333 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.19 
 
 		 11716 aa  44.3  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  25.76 
 
 		 143 aa  43.9  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>