27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3359 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  717    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  79.1 
 
 		 333 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1762  hypothetical protein  63.52 
 
 		 294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426629  normal  0.0904839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  31.25 
 
 		 235 aa  87  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  31.52 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  32.62 
 
 		 153 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  34.11 
 
 		 581 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  37.27 
 
 		 573 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1810  hypothetical protein  34.92 
 
 		 556 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1675  hypothetical protein  31.9 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.94 
 
 		 2507 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  34.58 
 
 		 576 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  36.45 
 
 		 602 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1070  hypothetical protein  28.57 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11650  hypothetical protein  28.43 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  29.31 
 
 		 800 aa  53.5  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  31.5 
 
 		 143 aa  53.1  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2346  hypothetical protein  26.09 
 
 		 300 aa  50.1  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2086  hypothetical protein  28.95 
 
 		 155 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  30.36 
 
 		 147 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  28.95 
 
 		 2039 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  26.67 
 
 		 542 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5971  hypothetical protein  35.8 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  0.464965 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3718  hypothetical protein  30.3 
 
 		 154 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.98166  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1113  hypothetical protein  24.6 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  27.52 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  32.88 
 
 		 2179 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>