27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2533 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  100 
 
 		 573 aa  1145    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  64.01 
 
 		 576 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  63.42 
 
 		 581 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  50.34 
 
 		 602 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1810  hypothetical protein  48.1 
 
 		 556 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  51.95 
 
 		 335 aa  150  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2346  hypothetical protein  39.22 
 
 		 300 aa  88.2  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1675  hypothetical protein  32.77 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  33.54 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  35.9 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  32.2 
 
 		 235 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  34.44 
 
 		 153 aa  65.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  36.36 
 
 		 542 aa  63.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  26.32 
 
 		 800 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  26.45 
 
 		 2039 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  36.49 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1762  hypothetical protein  31.25 
 
 		 294 aa  57  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426629  normal  0.0904839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  28.12 
 
 		 147 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0927  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1248 aa  55.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0959972  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  32.98 
 
 		 164 aa  55.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.08 
 
 		 2507 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  29.46 
 
 		 376 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0634  hypothetical protein  26.67 
 
 		 146 aa  47.4  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000800273  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1852  hypothetical protein  20.83 
 
 		 282 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.428196  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.12 
 
 		 11716 aa  45.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  25.1 
 
 		 410 aa  44.3  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>