36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1557 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  471  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  32.35 
 
 		 333 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  31.61 
 
 		 352 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1762  hypothetical protein  35.71 
 
 		 294 aa  88.6  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426629  normal  0.0904839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  29.89 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  36.89 
 
 		 2039 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1810  hypothetical protein  37.5 
 
 		 556 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  34.15 
 
 		 581 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  34.45 
 
 		 576 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  38.89 
 
 		 602 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1675  hypothetical protein  32.84 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  37.08 
 
 		 573 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  35.54 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.67 
 
 		 2507 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2346  hypothetical protein  28.48 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  27.18 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1113  hypothetical protein  31.09 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0634  hypothetical protein  33.7 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000800273  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  30.34 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  32.26 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  30.22 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  32.61 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  27.21 
 
 		 542 aa  56.2  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  26.92 
 
 		 800 aa  55.5  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1345  hypothetical protein  32.37 
 
 		 3121 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0927  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1248 aa  53.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0959972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  28.33 
 
 		 1334 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  31.37 
 
 		 2454 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  37.5 
 
 		 410 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1405  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3718  hypothetical protein  30.83 
 
 		 154 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.98166  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2086  hypothetical protein  31.91 
 
 		 155 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0096  hypothetical protein  29.85 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4566  hypothetical protein  26.32 
 
 		 369 aa  45.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  26.67 
 
 		 1381 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1852  hypothetical protein  25.96 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.428196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>