25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3718 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3718  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  308  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.98166  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2086  hypothetical protein  72.26 
 
 
155 aa  215  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  48.55 
 
 
143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  43.41 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  35.94 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  38.35 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  38.98 
 
 
153 aa  90.5  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0634  hypothetical protein  36.07 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000800273  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3598  hypothetical protein  33.09 
 
 
152 aa  77  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1405  hypothetical protein  35.65 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  28.1 
 
 
2454 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  27.52 
 
 
376 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0927  hypothetical protein  27.12 
 
 
1248 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0959972  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  30.83 
 
 
235 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  27.78 
 
 
2039 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  28.71 
 
 
335 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  30.3 
 
 
352 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  28.85 
 
 
800 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  30 
 
 
581 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  30 
 
 
576 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  28.46 
 
 
333 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  23.85 
 
 
586 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1113  hypothetical protein  27.97 
 
 
322 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303813  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  28.89 
 
 
602 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  28.57 
 
 
573 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>