54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0719 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  308  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0634  hypothetical protein  34.04 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000800273  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  31.2 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3718  hypothetical protein  38.98 
 
 		 154 aa  90.5  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.98166  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1405  hypothetical protein  40.68 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2086  hypothetical protein  37.39 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  34 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  32.62 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  32.09 
 
 		 2454 aa  68.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  30.83 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  34.11 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  34.44 
 
 		 573 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  29.71 
 
 		 581 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  33.33 
 
 		 576 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1852  hypothetical protein  29.41 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.428196  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1810  hypothetical protein  32.22 
 
 		 556 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1851  hypothetical protein  29.75 
 
 		 312 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  32.22 
 
 		 602 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  29.66 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  30.34 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0927  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1248 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0959972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.96 
 
 		 2507 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2346  hypothetical protein  34.44 
 
 		 300 aa  57.4  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  25.62 
 
 		 800 aa  53.9  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  28.99 
 
 		 2039 aa  53.9  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  22.82 
 
 		 376 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1675  hypothetical protein  31.31 
 
 		 296 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  30.88 
 
 		 410 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3598  hypothetical protein  22.66 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750539 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  26.55 
 
 		 453 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  26.55 
 
 		 453 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  26.55 
 
 		 453 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  26.55 
 
 		 453 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  29.11 
 
 		 287 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1762  hypothetical protein  29.66 
 
 		 294 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426629  normal  0.0904839 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  26.55 
 
 		 453 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  26.55 
 
 		 453 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  28.95 
 
 		 446 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  24.81 
 
 		 542 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1970  hypothetical protein  26.87 
 
 		 348 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000904058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27 
 
 		 11716 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  25.74 
 
 		 454 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  25.74 
 
 		 448 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  25.74 
 
 		 454 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  25.74 
 
 		 454 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  25.74 
 
 		 448 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  25.74 
 
 		 448 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1113  hypothetical protein  23.48 
 
 		 322 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  25.74 
 
 		 454 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  25.74 
 
 		 454 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  27.05 
 
 		 554 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3164  hypothetical protein  30.51 
 
 		 214 aa  41.2  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4566  hypothetical protein  27.94 
 
 		 369 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  0.153993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>