23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2346 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2346  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  580  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  35.29 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  32.45 
 
 		 602 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  42.16 
 
 		 581 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1810  hypothetical protein  37.74 
 
 		 556 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  40.2 
 
 		 576 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  39.22 
 
 		 573 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1675  hypothetical protein  31.06 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  27.89 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  26.64 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  32.54 
 
 		 164 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  34.83 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  34.44 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  30.68 
 
 		 800 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1762  hypothetical protein  24.11 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426629  normal  0.0904839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  31.82 
 
 		 376 aa  53.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  26.03 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  27.5 
 
 		 2039 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1970  hypothetical protein  27.66 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000904058  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1405  hypothetical protein  29.41 
 
 		 155 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  27.48 
 
 		 542 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.51 
 
 		 2507 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  27.34 
 
 		 143 aa  42.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>