48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1405 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1405  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  305  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  43.17 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0634  hypothetical protein  34.06 
 
 		 146 aa  90.1  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000800273  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  40.68 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  34.35 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  31.43 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3718  hypothetical protein  35.65 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.98166  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2086  hypothetical protein  34.78 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  32.06 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  27.54 
 
 		 376 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  31.62 
 
 		 453 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  31.62 
 
 		 453 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  31.62 
 
 		 453 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  34.78 
 
 		 2454 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  34.44 
 
 		 800 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.55 
 
 		 2507 aa  53.9  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  30.15 
 
 		 453 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  30.15 
 
 		 453 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  29.41 
 
 		 453 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3598  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750539 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.51 
 
 		 11716 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  29.2 
 
 		 446 aa  51.2  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  28.79 
 
 		 2039 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  29.05 
 
 		 454 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  27.27 
 
 		 235 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  29.05 
 
 		 448 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  29.05 
 
 		 454 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  29.05 
 
 		 448 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  29.05 
 
 		 454 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  29.05 
 
 		 448 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  29.05 
 
 		 454 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2346  hypothetical protein  31.15 
 
 		 300 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  29.05 
 
 		 454 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  28.47 
 
 		 484 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  35.63 
 
 		 559 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  32.71 
 
 		 559 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  33.71 
 
 		 568 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  29.17 
 
 		 484 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  26.24 
 
 		 410 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  31.33 
 
 		 333 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1113  hypothetical protein  28.72 
 
 		 322 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 1272 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  24.44 
 
 		 335 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  30.21 
 
 		 543 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  31.33 
 
 		 352 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  29.79 
 
 		 1237 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4566  hypothetical protein  26.72 
 
 		 369 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1852  hypothetical protein  26.98 
 
 		 282 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.428196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>