25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2345 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  75.26 
 
 		 576 aa  781    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  100 
 
 		 581 aa  1162    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  63.08 
 
 		 573 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1810  hypothetical protein  50.25 
 
 		 556 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  51.27 
 
 		 602 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  56.06 
 
 		 335 aa  146  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2346  hypothetical protein  42.16 
 
 		 300 aa  90.9  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1675  hypothetical protein  34.45 
 
 		 296 aa  87.4  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  32.45 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  35.66 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  32.26 
 
 		 333 aa  67  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  29.71 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1762  hypothetical protein  31.25 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426629  normal  0.0904839 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  34.15 
 
 		 542 aa  57.4  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  28.21 
 
 		 2039 aa  57.4  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  37.84 
 
 		 143 aa  56.6  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  29.47 
 
 		 147 aa  55.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  30.21 
 
 		 376 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0927  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1248 aa  55.1  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0959972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.65 
 
 		 2507 aa  52  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  31.91 
 
 		 164 aa  51.2  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  28.89 
 
 		 143 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1852  hypothetical protein  25 
 
 		 282 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.428196  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  23.93 
 
 		 800 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 11716 aa  47.4  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>