32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0927 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0927  hypothetical protein  100 
 
 
1248 aa  2520    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0959972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  35.97 
 
 
147 aa  77.4  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  26.37 
 
 
287 aa  66.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  29.2 
 
 
2454 aa  63.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  25.89 
 
 
376 aa  63.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.63 
 
 
11716 aa  61.6  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  29.91 
 
 
143 aa  60.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  29.55 
 
 
410 aa  59.3  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  27.64 
 
 
153 aa  58.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1113  hypothetical protein  34.04 
 
 
322 aa  57  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303813  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.88 
 
 
2507 aa  56.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  31.87 
 
 
573 aa  55.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0634  hypothetical protein  26.47 
 
 
146 aa  55.1  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000800273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  30.3 
 
 
2039 aa  54.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  30.71 
 
 
542 aa  54.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  31.87 
 
 
581 aa  53.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  31.87 
 
 
576 aa  54.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  25.17 
 
 
235 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  31.52 
 
 
602 aa  53.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1810  hypothetical protein  30.43 
 
 
556 aa  52  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2086  hypothetical protein  26.96 
 
 
155 aa  50.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  50.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3718  hypothetical protein  27.12 
 
 
154 aa  49.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.98166  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  25.37 
 
 
586 aa  48.9  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1852  hypothetical protein  25.39 
 
 
282 aa  48.9  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.428196  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  30.85 
 
 
335 aa  48.5  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  25.2 
 
 
143 aa  48.5  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  24.86 
 
 
1334 aa  48.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  25.68 
 
 
1381 aa  48.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1705  hypothetical protein  29.93 
 
 
259 aa  45.4  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1345  hypothetical protein  23.03 
 
 
3121 aa  45.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0316  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  53.19 
 
 
367 aa  45.1  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>