24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0770 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0770  hypothetical protein  100 
 
 
953 aa  1927    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5612  hypothetical protein  39.12 
 
 
809 aa  178  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352581  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46087  predicted protein  32.9 
 
 
907 aa  171  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5663  hypothetical protein  39.24 
 
 
846 aa  161  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198442  normal  0.529152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3101  putative serine protease protein  29.84 
 
 
664 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.672072  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  29.79 
 
 
1056 aa  138  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1059  hypothetical protein  31.41 
 
 
867 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.724873  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_003296  RS03876  putative serine protease protein  28.43 
 
 
663 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4257  fibronectin type III domain-containing protein  30.46 
 
 
634 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.735386  normal  0.703985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0947  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.61 
 
 
746 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172649  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1890  cell surface protein  30.24 
 
 
671 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.642058  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 
1121 aa  115  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2494  cell surface protein  26.13 
 
 
462 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.909338  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4222  hypothetical protein  30.73 
 
 
1233 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.514353  normal  0.0934006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2604  Fibronectin type III domain protein  29.9 
 
 
716 aa  108  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248661  hitchhiker  0.00161973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5141  Proprotein convertase P  30.8 
 
 
938 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.488081  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  41.74 
 
 
2039 aa  73.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  32.62 
 
 
641 aa  49.3  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.65 
 
 
636 aa  47.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.382458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2485  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.51 
 
 
650 aa  47.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  35.19 
 
 
2105 aa  46.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  40 
 
 
606 aa  46.2  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  49.15 
 
 
971 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2634  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 
710 aa  45.8  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>