105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3331 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  33.22 
 
 		 5020 aa  945    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  40.42 
 
 		 4854 aa  1114    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  33.9 
 
 		 4285 aa  793    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.77 
 
 		 2812 aa  640    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 3439 aa  6562    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  84.23 
 
 		 4120 aa  843    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  37.41 
 
 		 2567 aa  744    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  26.92 
 
 		 4661 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  34.02 
 
 		 5094 aa  504  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  55.32 
 
 		 3736 aa  502  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  55.17 
 
 		 3734 aa  503  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  30.94 
 
 		 3259 aa  498  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  28.63 
 
 		 3758 aa  495  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  29.25 
 
 		 3229 aa  423  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  28.81 
 
 		 2784 aa  415  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  35.33 
 
 		 2743 aa  395  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.84 
 
 		 5745 aa  314  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.01 
 
 		 2239 aa  313  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  28.05 
 
 		 16311 aa  284  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  28.84 
 
 		 1883 aa  254  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  26.96 
 
 		 4978 aa  243  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  26.57 
 
 		 8871 aa  231  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  32.95 
 
 		 2127 aa  229  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  27.97 
 
 		 3714 aa  229  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  30.12 
 
 		 1206 aa  214  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.4 
 
 		 14916 aa  201  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.79 
 
 		 2067 aa  197  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  27.6 
 
 		 6678 aa  186  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  24.26 
 
 		 3182 aa  172  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.33 
 
 		 1884 aa  168  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  35.13 
 
 		 1141 aa  167  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  28.62 
 
 		 3508 aa  162  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.95 
 
 		 1553 aa  149  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  24.4 
 
 		 8321 aa  142  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  25.52 
 
 		 3132 aa  142  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  26.62 
 
 		 2524 aa  134  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  26.59 
 
 		 2555 aa  130  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  26.35 
 
 		 3927 aa  129  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  26.63 
 
 		 2887 aa  122  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  24.88 
 
 		 3091 aa  112  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  27.71 
 
 		 2461 aa  111  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  26.43 
 
 		 2853 aa  107  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  24.58 
 
 		 2377 aa  98.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.06 
 
 		 1963 aa  97.8  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  27.62 
 
 		 1706 aa  95.9  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  25.62 
 
 		 2820 aa  94.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  30.59 
 
 		 2337 aa  93.2  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  28.86 
 
 		 1597 aa  84.7  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  33.75 
 
 		 3026 aa  81.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.18 
 
 		 1599 aa  80.5  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0782  von Willebrand factor type A  23.58 
 
 		 5009 aa  78.2  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.44 
 
 		 2812 aa  75.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  25.13 
 
 		 1867 aa  71.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.86 
 
 		 4122 aa  70.5  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  27.22 
 
 		 2074 aa  69.7  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  32.08 
 
 		 1728 aa  66.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1512 aa  63.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  38.98 
 
 		 1838 aa  63.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  28.98 
 
 		 1416 aa  62.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.76 
 
 		 4836 aa  61.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.09 
 
 		 2507 aa  60.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  27.14 
 
 		 7284 aa  60.8  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  28.92 
 
 		 666 aa  60.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.8 
 
 		 1949 aa  59.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  23.73 
 
 		 2795 aa  59.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  31.94 
 
 		 1598 aa  59.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  27.11 
 
 		 4672 aa  59.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  42.71 
 
 		 460 aa  57.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  43.96 
 
 		 757 aa  57  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40 
 
 		 2668 aa  56.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  40 
 
 		 460 aa  56.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1354  hypothetical protein  40.96 
 
 		 359 aa  55.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  26.58 
 
 		 3191 aa  54.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 980 aa  54.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  26.06 
 
 		 1428 aa  53.5  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  32.89 
 
 		 2816 aa  53.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 		 341 aa  53.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 		 341 aa  53.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  36.8 
 
 		 1143 aa  53.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  26.69 
 
 		 5442 aa  52.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  24.65 
 
 		 4791 aa  52.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  24.34 
 
 		 9867 aa  52  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.95 
 
 		 850 aa  52  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.2 
 
 		 994 aa  52  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.51 
 
 		 5839 aa  51.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.55 
 
 		 1056 aa  52  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.98 
 
 		 1063 aa  52.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  32.12 
 
 		 2039 aa  51.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  40.62 
 
 		 615 aa  52.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.09 
 
 		 1067 aa  51.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.13 
 
 		 2667 aa  50.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.14 
 
 		 3699 aa  51.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  30.58 
 
 		 1390 aa  50.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.13 
 
 		 1236 aa  49.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  37.5 
 
 		 686 aa  49.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 2885 aa  48.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1718  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.34 
 
 		 777 aa  48.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0847  putative outer membrane adhesin like protein  27.12 
 
 		 567 aa  48.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189392  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  24.54 
 
 		 3699 aa  48.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  34.23 
 
 		 7149 aa  48.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>