236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0367 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0367  VCBS  100 
 
 
6678 aa  13120    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  35.59 
 
 
4661 aa  643    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  35.18 
 
 
4285 aa  568  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  31.76 
 
 
3229 aa  551  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  33.21 
 
 
3259 aa  550  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.61 
 
 
8871 aa  481  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  30.41 
 
 
16311 aa  439  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  31.03 
 
 
3132 aa  409  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.28 
 
 
2067 aa  398  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  29.62 
 
 
2567 aa  347  5.999999999999999e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  27.95 
 
 
2784 aa  322  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.29 
 
 
1553 aa  306  8.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  28.05 
 
 
4854 aa  303  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  27.05 
 
 
5020 aa  292  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  30.55 
 
 
2743 aa  266  8.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  28.27 
 
 
8321 aa  261  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  30.39 
 
 
1883 aa  261  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  32.13 
 
 
2127 aa  244  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.39 
 
 
2812 aa  223  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  27.44 
 
 
3439 aa  218  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.67 
 
 
1963 aa  216  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  31.43 
 
 
2555 aa  216  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  29.18 
 
 
3714 aa  215  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.73 
 
 
1599 aa  201  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  25.32 
 
 
3182 aa  193  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  34.89 
 
 
2924 aa  177  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  27.23 
 
 
3508 aa  176  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  27.81 
 
 
1206 aa  167  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  30.12 
 
 
2461 aa  167  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  55.19 
 
 
2807 aa  165  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  53.3 
 
 
1143 aa  164  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.69 
 
 
2239 aa  162  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  25.25 
 
 
3758 aa  159  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  66.13 
 
 
1838 aa  156  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  40.1 
 
 
4379 aa  145  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  36.86 
 
 
2820 aa  145  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  50.26 
 
 
7284 aa  144  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  43.13 
 
 
726 aa  142  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  35.37 
 
 
3391 aa  140  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  32.32 
 
 
2853 aa  140  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  25.11 
 
 
3091 aa  137  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  40.88 
 
 
912 aa  135  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  36.92 
 
 
1289 aa  135  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.74 
 
 
14916 aa  133  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  31.59 
 
 
1428 aa  131  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  30.1 
 
 
4465 aa  130  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  37.05 
 
 
2132 aa  126  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  33.8 
 
 
8980 aa  125  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  34.64 
 
 
2039 aa  125  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  42.86 
 
 
2133 aa  125  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  24.88 
 
 
3699 aa  124  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  32.67 
 
 
3562 aa  123  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  40.64 
 
 
5094 aa  122  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  38.66 
 
 
9867 aa  121  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.31 
 
 
3363 aa  120  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  36.65 
 
 
426 aa  116  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  34.68 
 
 
3066 aa  117  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  33.33 
 
 
2001 aa  115  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.88 
 
 
3699 aa  114  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  26.85 
 
 
2887 aa  114  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  41.84 
 
 
1757 aa  113  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  25.87 
 
 
3544 aa  111  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  41.1 
 
 
1019 aa  109  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  32.8 
 
 
2060 aa  110  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  65.96 
 
 
7149 aa  110  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
12741 aa  109  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.56 
 
 
1884 aa  108  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  29.95 
 
 
1367 aa  107  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  41.56 
 
 
1855 aa  107  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.48 
 
 
2678 aa  106  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  42.78 
 
 
492 aa  105  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.69 
 
 
11716 aa  105  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  42.57 
 
 
4334 aa  105  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  31.51 
 
 
1141 aa  103  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  37.09 
 
 
3954 aa  103  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  40.85 
 
 
2506 aa  99.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  38.56 
 
 
922 aa  98.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.82 
 
 
2507 aa  97.8  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  35 
 
 
2715 aa  97.4  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  38.27 
 
 
1557 aa  95.9  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  37.24 
 
 
940 aa  95.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  32.58 
 
 
337 aa  94.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  36.81 
 
 
938 aa  94  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  34.26 
 
 
3378 aa  92.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  26.01 
 
 
3927 aa  92  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  61.22 
 
 
1586 aa  91.3  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  33.33 
 
 
3026 aa  89.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  30.86 
 
 
4120 aa  89.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  30.77 
 
 
2802 aa  89.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  32.48 
 
 
917 aa  88.2  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.79 
 
 
3427 aa  88.2  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  31.72 
 
 
3089 aa  86.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  38.36 
 
 
3193 aa  85.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  33.99 
 
 
824 aa  86.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  30.29 
 
 
1728 aa  84.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  31.64 
 
 
1022 aa  82.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  31.64 
 
 
1017 aa  83.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  34.67 
 
 
3222 aa  82.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  30.52 
 
 
1260 aa  82.4  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0905  Ig family protein  33.78 
 
 
3230 aa  80.5  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>