More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3767 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 1757 aa  3364    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  36.96 
 
 		 768 aa  275  4.0000000000000004e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  48.23 
 
 		 3477 aa  189  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  43.26 
 
 		 3474 aa  182  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  36.48 
 
 		 2715 aa  178  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  36.93 
 
 		 2506 aa  146  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.19 
 
 		 3977 aa  145  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  34.11 
 
 		 2001 aa  122  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  33.55 
 
 		 1526 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  27.92 
 
 		 9867 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  39.64 
 
 		 2132 aa  110  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  43.83 
 
 		 2820 aa  105  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  35.2 
 
 		 2182 aa  105  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0905  Ig family protein  31.72 
 
 		 3230 aa  105  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  37.12 
 
 		 8871 aa  103  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  46.45 
 
 		 6678 aa  99.4  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  30.1 
 
 		 3222 aa  97.8  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  29.3 
 
 		 16311 aa  94.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  33.18 
 
 		 3066 aa  88.6  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  41.98 
 
 		 3089 aa  85.9  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  36.07 
 
 		 2807 aa  85.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0296  Ig family protein  28.13 
 
 		 1699 aa  84  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  40.98 
 
 		 3927 aa  83.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  30.32 
 
 		 2555 aa  82.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  27.73 
 
 		 2127 aa  80.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.14 
 
 		 862 aa  80.5  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  34.67 
 
 		 5769 aa  75.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0931  hemolysin-type calcium-binding region  29.67 
 
 		 484 aa  73.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0749025  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  32.17 
 
 		 5094 aa  71.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  27.1 
 
 		 785 aa  69.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.31 
 
 		 11716 aa  68.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  45.24 
 
 		 795 aa  68.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  31.61 
 
 		 6276 aa  67.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  43.68 
 
 		 4334 aa  65.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1403  hemolysin-type calcium-binding region  27.46 
 
 		 482 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  41.49 
 
 		 243 aa  63.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  29.71 
 
 		 912 aa  63.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  52.54 
 
 		 2542 aa  62.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  36.62 
 
 		 833 aa  62.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  38.78 
 
 		 932 aa  62  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1794  hypothetical protein  38.33 
 
 		 480 aa  62  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  38.61 
 
 		 1156 aa  62  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  37.6 
 
 		 361 aa  61.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  23.74 
 
 		 615 aa  62  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  36.7 
 
 		 202 aa  62  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.01 
 
 		 1963 aa  61.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  36.7 
 
 		 202 aa  62  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1896  hypothetical protein  27.35 
 
 		 574 aa  61.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  41 
 
 		 851 aa  60.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  39.84 
 
 		 582 aa  60.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  29.41 
 
 		 1499 aa  60.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  46.48 
 
 		 769 aa  60.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  39.02 
 
 		 585 aa  60.1  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.95 
 
 		 4798 aa  60.1  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  43.42 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  36.73 
 
 		 928 aa  59.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  31.85 
 
 		 1424 aa  59.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  39.02 
 
 		 679 aa  59.3  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  41.33 
 
 		 1594 aa  59.3  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  41.67 
 
 		 3619 aa  58.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  41.67 
 
 		 3619 aa  58.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  32.24 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  34.72 
 
 		 1586 aa  58.9  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  41.38 
 
 		 1202 aa  58.9  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  42.35 
 
 		 2689 aa  58.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 		 507 aa  58.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  35.64 
 
 		 1383 aa  58.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  37.93 
 
 		 361 aa  58.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  34.72 
 
 		 1022 aa  58.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  34.72 
 
 		 1017 aa  58.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.89 
 
 		 980 aa  57.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  37.93 
 
 		 361 aa  58.2  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0275  Hemolysin-type calcium-binding region  43.04 
 
 		 206 aa  57.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  28.8 
 
 		 1428 aa  58.2  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  37.1 
 
 		 1112 aa  57.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  35.45 
 
 		 467 aa  57.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.35 
 
 		 1180 aa  57.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  36.64 
 
 		 2775 aa  57  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  38.79 
 
 		 2667 aa  57  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  39.29 
 
 		 2329 aa  57  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  38.24 
 
 		 8321 aa  56.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  41.25 
 
 		 245 aa  56.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  40.91 
 
 		 1055 aa  55.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1699  hypothetical protein  24.1 
 
 		 593 aa  55.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00360282  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  42.7 
 
 		 2336 aa  56.2  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  30 
 
 		 2885 aa  55.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 		 946 aa  55.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  32.86 
 
 		 1306 aa  55.5  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  44 
 
 		 741 aa  55.5  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  43.59 
 
 		 1279 aa  55.5  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 		 5839 aa  55.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  34.68 
 
 		 4800 aa  55.5  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 375 aa  55.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  35.09 
 
 		 1019 aa  55.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  35.29 
 
 		 713 aa  54.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  44.59 
 
 		 928 aa  54.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  55.77 
 
 		 1434 aa  55.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20961  hemolysin-type calcium-binding domain-containing protein  43.02 
 
 		 2082 aa  55.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  35.35 
 
 		 2145 aa  55.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.59 
 
 		 3427 aa  55.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>