144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1597 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  100 
 
 		 1289 aa  2560    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  36.68 
 
 		 1557 aa  290  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  36 
 
 		 2807 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  33.39 
 
 		 4379 aa  238  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  31.39 
 
 		 1838 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  38.66 
 
 		 1019 aa  173  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.69 
 
 		 1340 aa  155  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.8 
 
 		 1118 aa  153  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.69 
 
 		 1225 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.29 
 
 		 889 aa  151  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.4 
 
 		 2194 aa  151  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.14 
 
 		 1113 aa  151  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.77 
 
 		 1009 aa  138  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.92 
 
 		 1222 aa  138  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  36.92 
 
 		 6678 aa  135  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  43.32 
 
 		 2852 aa  131  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  32.95 
 
 		 828 aa  129  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.41 
 
 		 1012 aa  128  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  32.09 
 
 		 872 aa  119  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  33.2 
 
 		 386 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  33.8 
 
 		 1126 aa  108  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  30.26 
 
 		 554 aa  108  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  33.23 
 
 		 1490 aa  108  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1722  hypothetical protein  50.43 
 
 		 1013 aa  106  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.919333  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.13 
 
 		 891 aa  104  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.97 
 
 		 3977 aa  104  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  32.03 
 
 		 644 aa  102  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  29.58 
 
 		 813 aa  99.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  31.51 
 
 		 974 aa  99.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  28.61 
 
 		 412 aa  98.6  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  32.11 
 
 		 604 aa  92.8  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  40.14 
 
 		 1587 aa  87.4  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  29.23 
 
 		 1275 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  36.51 
 
 		 692 aa  82.8  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  27.33 
 
 		 657 aa  82.4  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  28.86 
 
 		 472 aa  77.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  44 
 
 		 2024 aa  76.6  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  31.72 
 
 		 469 aa  77  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  33.78 
 
 		 662 aa  75.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  30.13 
 
 		 685 aa  75.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  38.69 
 
 		 1126 aa  75.1  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  27.6 
 
 		 616 aa  73.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  31.3 
 
 		 3197 aa  72.8  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  31.78 
 
 		 3197 aa  72  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  32.61 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  29.23 
 
 		 663 aa  70.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  27.54 
 
 		 506 aa  68.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  27.51 
 
 		 494 aa  67  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  28.64 
 
 		 720 aa  66.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  24.86 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  27.27 
 
 		 1109 aa  65.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  27.76 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  34.65 
 
 		 3834 aa  64.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  27.82 
 
 		 1124 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1127 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3628  FG-GAP repeat protein  26.3 
 
 		 829 aa  63.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1638 aa  63.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.18 
 
 		 11716 aa  63.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  26.67 
 
 		 485 aa  63.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.36 
 
 		 1154 aa  62.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.22 
 
 		 621 aa  62.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  24.68 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.93 
 
 		 2678 aa  62  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  28.57 
 
 		 760 aa  61.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  32.88 
 
 		 1933 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  24.83 
 
 		 574 aa  59.7  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  33.78 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  28.37 
 
 		 8871 aa  58.9  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.81 
 
 		 1372 aa  59.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  26.16 
 
 		 690 aa  58.9  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  35.45 
 
 		 2182 aa  58.2  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  27.99 
 
 		 1328 aa  58.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  23.01 
 
 		 1022 aa  58.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  25.18 
 
 		 1094 aa  57.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1575 aa  57.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  30.13 
 
 		 16311 aa  55.8  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.04 
 
 		 600 aa  55.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  24.04 
 
 		 917 aa  55.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  27.91 
 
 		 437 aa  55.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  27.48 
 
 		 510 aa  53.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1210 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3748  hypothetical protein  27.92 
 
 		 463 aa  54.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  24.78 
 
 		 417 aa  53.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4648  hypothetical protein  35.96 
 
 		 110 aa  53.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  26.37 
 
 		 1133 aa  52.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  34.96 
 
 		 3089 aa  52.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  31.97 
 
 		 3608 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  28.57 
 
 		 837 aa  52  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.34 
 
 		 1114 aa  52  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.26 
 
 		 453 aa  52  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  26.18 
 
 		 803 aa  52  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  31.15 
 
 		 3619 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  24.86 
 
 		 649 aa  51.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  27.12 
 
 		 1129 aa  51.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  37.74 
 
 		 904 aa  50.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.64 
 
 		 655 aa  51.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  31.97 
 
 		 3619 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  39.36 
 
 		 2345 aa  51.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  26.64 
 
 		 883 aa  50.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  24.39 
 
 		 2497 aa  50.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>