108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0905 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0296  Ig family protein  32.39 
 
 
1699 aa  645    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112212  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  75.07 
 
 
3222 aa  4760    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0905  Ig family protein  100 
 
 
3230 aa  6432    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  30.74 
 
 
2506 aa  228  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  31.72 
 
 
1757 aa  104  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  39.62 
 
 
2001 aa  88.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  37.01 
 
 
2132 aa  82.4  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  31.84 
 
 
3477 aa  73.2  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  41.59 
 
 
3089 aa  72.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  35.66 
 
 
16311 aa  70.9  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  27.9 
 
 
2853 aa  70.1  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  37.88 
 
 
3391 aa  68.6  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  33.78 
 
 
6678 aa  67  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  32.92 
 
 
8871 aa  63.9  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.87 
 
 
11716 aa  63.5  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  28.29 
 
 
480 aa  62  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  30 
 
 
3598 aa  62  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  25.72 
 
 
359 aa  62  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  51.92 
 
 
2402 aa  60.5  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  25.98 
 
 
373 aa  59.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  39.8 
 
 
1728 aa  58.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.57 
 
 
2807 aa  57.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  32.39 
 
 
1610 aa  57  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  34.96 
 
 
1610 aa  55.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  25.9 
 
 
355 aa  55.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  27.53 
 
 
353 aa  55.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  25.21 
 
 
380 aa  55.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  25.52 
 
 
446 aa  54.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  25.48 
 
 
381 aa  55.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  45.45 
 
 
1081 aa  54.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  27.27 
 
 
349 aa  54.7  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  34.68 
 
 
2820 aa  54.3  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  28.48 
 
 
372 aa  54.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  38.64 
 
 
2337 aa  53.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  38 
 
 
2954 aa  53.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  30.3 
 
 
354 aa  53.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.33 
 
 
522 aa  53.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  26.97 
 
 
350 aa  52.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  25 
 
 
1667 aa  52.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  26.44 
 
 
376 aa  52.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  30 
 
 
377 aa  51.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  27.37 
 
 
367 aa  52  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  32.28 
 
 
731 aa  52  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  24.12 
 
 
331 aa  52  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  30.96 
 
 
1879 aa  52  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.7 
 
 
521 aa  51.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  24.07 
 
 
384 aa  52  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  25.76 
 
 
415 aa  51.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  25.76 
 
 
415 aa  51.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  25.76 
 
 
415 aa  51.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  28.66 
 
 
332 aa  50.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1703  hypothetical protein  24.32 
 
 
357 aa  50.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  33.07 
 
 
4231 aa  50.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.42 
 
 
457 aa  50.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  34.21 
 
 
9867 aa  50.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  28.4 
 
 
354 aa  50.1  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  24.51 
 
 
385 aa  50.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  25.74 
 
 
819 aa  50.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  33.33 
 
 
355 aa  49.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  27.61 
 
 
355 aa  49.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  40 
 
 
1030 aa  49.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2784  hypothetical protein  23.56 
 
 
436 aa  49.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  23.9 
 
 
331 aa  49.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  33.33 
 
 
354 aa  49.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  23.85 
 
 
331 aa  48.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  25.96 
 
 
375 aa  48.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  25.96 
 
 
363 aa  48.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  23.85 
 
 
331 aa  48.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  23.85 
 
 
331 aa  48.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  23.85 
 
 
331 aa  48.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  25.21 
 
 
431 aa  48.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  26.06 
 
 
353 aa  48.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  38.89 
 
 
3542 aa  48.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  34.51 
 
 
1672 aa  48.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  29.89 
 
 
359 aa  48.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  33.33 
 
 
354 aa  48.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  32.94 
 
 
1342 aa  47.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  25.47 
 
 
404 aa  47.8  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  35.71 
 
 
3911 aa  48.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  25.52 
 
 
363 aa  48.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2089  hypothetical protein  30.46 
 
 
850 aa  47.8  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645532  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.88 
 
 
1067 aa  47.8  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  26.11 
 
 
332 aa  47.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  25 
 
 
355 aa  47.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  32.39 
 
 
4465 aa  47.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2221  3-carboxymuconate cyclase-like protein  35.56 
 
 
349 aa  47.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  25.49 
 
 
331 aa  47.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  25 
 
 
414 aa  47.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1090  6-phosphogluconolactonase  40.66 
 
 
348 aa  47.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  23.58 
 
 
331 aa  47.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  30.69 
 
 
3563 aa  47.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  32.32 
 
 
355 aa  47.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2972  quinohemoprotein amine dehydrogenase, subunit beta  27.06 
 
 
362 aa  47  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.81 
 
 
320 aa  47  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  26.05 
 
 
385 aa  47  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  31.62 
 
 
1129 aa  47  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  24.04 
 
 
353 aa  47  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  32.32 
 
 
355 aa  46.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  32.32 
 
 
353 aa  46.6  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.25 
 
 
692 aa  47  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>