25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0296 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0905  Ig family protein  32.68 
 
 		 3230 aa  660    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  32.9 
 
 		 3222 aa  695    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0296  Ig family protein  100 
 
 		 1699 aa  3357    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  29.16 
 
 		 2506 aa  245  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  28.57 
 
 		 1757 aa  85.1  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  39.18 
 
 		 2001 aa  83.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.68 
 
 		 8871 aa  57.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  26.57 
 
 		 3477 aa  57.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  32.47 
 
 		 2132 aa  55.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  35.35 
 
 		 3542 aa  54.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  34.97 
 
 		 9867 aa  52.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.09 
 
 		 2807 aa  51.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  32 
 
 		 3089 aa  51.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  27.65 
 
 		 370 aa  50.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.28 
 
 		 11716 aa  48.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1746  3-carboxymuconate cyclase-like protein  28.12 
 
 		 328 aa  48.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00917254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  23.73 
 
 		 388 aa  47.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  31.4 
 
 		 355 aa  47.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  28.82 
 
 		 16311 aa  47.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  51.11 
 
 		 2402 aa  47  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  45.16 
 
 		 1232 aa  47  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  39.24 
 
 		 1342 aa  45.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.41 
 
 		 521 aa  45.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  29.47 
 
 		 1143 aa  45.4  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  23.05 
 
 		 388 aa  45.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>