32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2972 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2972  quinohemoprotein amine dehydrogenase, subunit beta  100 
 
 		 362 aa  748    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1706  quinohemoprotein amine dehydrogenase, subunit beta  46.76 
 
 		 358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.472074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3459  hypothetical protein  29.95 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.876631  normal  0.354488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2310  hypothetical protein  29.95 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2478  hypothetical protein  30.51 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0764  quinohemoprotein amine dehydrogease,beta subunit  29.61 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2942  quinohemoprotein amine dehydrogenase 40 kDa subunit  28.99 
 
 		 373 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.818526  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2979  quinohemoprotein amine dehydrogenase 40 kDa subunit  29.76 
 
 		 376 aa  139  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49844  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3498  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.33 
 
 		 540 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631028 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3031  hypothetical protein  22.35 
 
 		 366 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00944915  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0905  Ig family protein  27.06 
 
 		 3230 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1553 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  30.67 
 
 		 317 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.51 
 
 		 329 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.9 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.9 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.22 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.36 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.77 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.92 
 
 		 1028 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  22.68 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  30.07 
 
 		 1163 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.7 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  26.06 
 
 		 1484 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.78 
 
 		 1481 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.78 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.47 
 
 		 321 aa  43.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  23.05 
 
 		 1229 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.67 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.52 
 
 		 328 aa  42.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  19.78 
 
 		 580 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.52 
 
 		 328 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>