171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5260 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  100 
 
 		 1879 aa  3560    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  42.67 
 
 		 1672 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  34.37 
 
 		 3544 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  37.08 
 
 		 3699 aa  357  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.3 
 
 		 3699 aa  344  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  54.06 
 
 		 2042 aa  333  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.44 
 
 		 1673 aa  306  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  36.13 
 
 		 2522 aa  305  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  49.67 
 
 		 2503 aa  292  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  38.74 
 
 		 2476 aa  275  5.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  50.84 
 
 		 2192 aa  215  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  40.67 
 
 		 1222 aa  214  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  53.82 
 
 		 1911 aa  197  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  36.95 
 
 		 1232 aa  162  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  30.95 
 
 		 9585 aa  155  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  35.14 
 
 		 3911 aa  155  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  25.16 
 
 		 2402 aa  144  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  29.4 
 
 		 2074 aa  133  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  37.71 
 
 		 1544 aa  132  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.19 
 
 		 692 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  28.84 
 
 		 3563 aa  121  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  36.72 
 
 		 813 aa  120  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  26.54 
 
 		 2194 aa  119  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  27.59 
 
 		 2839 aa  114  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  27.23 
 
 		 4231 aa  113  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  30.52 
 
 		 1269 aa  107  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.39 
 
 		 994 aa  107  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  33.09 
 
 		 1268 aa  103  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.23 
 
 		 11716 aa  102  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  33.25 
 
 		 3542 aa  100  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  32.8 
 
 		 683 aa  101  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  26.3 
 
 		 1359 aa  97.8  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  26.65 
 
 		 2886 aa  94.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  28.2 
 
 		 1779 aa  94  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  35.45 
 
 		 2052 aa  93.2  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  34.51 
 
 		 2011 aa  91.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  30.94 
 
 		 1597 aa  90.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  29.04 
 
 		 1269 aa  90.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  33.21 
 
 		 1628 aa  90.5  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3285  Outer membrane autotransporter barrel  28.46 
 
 		 1895 aa  90.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.761058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  49.21 
 
 		 1550 aa  90.5  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  28.15 
 
 		 2079 aa  90.1  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  52.05 
 
 		 1394 aa  90.1  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  59.55 
 
 		 1848 aa  89.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  27.84 
 
 		 3474 aa  89.4  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  41.94 
 
 		 891 aa  87.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.88 
 
 		 1272 aa  86.7  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  29.98 
 
 		 2040 aa  85.9  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.65 
 
 		 850 aa  85.1  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  28.67 
 
 		 2047 aa  84  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  30.21 
 
 		 4854 aa  81.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.46 
 
 		 4220 aa  81.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0322  hypothetical protein  31.93 
 
 		 409 aa  80.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.620183  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  33.02 
 
 		 2084 aa  80.5  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  32.43 
 
 		 864 aa  79  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  31.17 
 
 		 2043 aa  78.6  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  29.67 
 
 		 1771 aa  78.2  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  26.2 
 
 		 2067 aa  77.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  26.01 
 
 		 4848 aa  77.4  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.01 
 
 		 887 aa  77.4  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  28.81 
 
 		 3244 aa  75.5  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.46 
 
 		 1884 aa  75.1  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  32.13 
 
 		 865 aa  74.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  30.4 
 
 		 2636 aa  73.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  42.02 
 
 		 1625 aa  72.8  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.6 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  29.51 
 
 		 3477 aa  72  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  37.34 
 
 		 731 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.14 
 
 		 761 aa  70.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  30.28 
 
 		 2051 aa  69.7  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  28.45 
 
 		 1367 aa  69.7  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  31.19 
 
 		 2377 aa  69.3  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  30.56 
 
 		 2039 aa  69.7  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  29.96 
 
 		 1129 aa  69.3  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  24.84 
 
 		 4978 aa  68.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  35.17 
 
 		 744 aa  68.9  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  24.71 
 
 		 1363 aa  68.9  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  30.23 
 
 		 7284 aa  68.6  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  27.65 
 
 		 1462 aa  68.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  28.82 
 
 		 2056 aa  67.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  41.46 
 
 		 1170 aa  68.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  30.14 
 
 		 2816 aa  67  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  47.06 
 
 		 1030 aa  66.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.25 
 
 		 4122 aa  66.6  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  42.17 
 
 		 618 aa  65.9  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  28.04 
 
 		 5745 aa  65.9  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  39.39 
 
 		 471 aa  65.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.29 
 
 		 878 aa  64.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  27.31 
 
 		 16322 aa  63.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  27.14 
 
 		 4465 aa  63.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  27.05 
 
 		 892 aa  61.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  29.11 
 
 		 2262 aa  61.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  25.27 
 
 		 2193 aa  61.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  31.06 
 
 		 1416 aa  60.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  30.37 
 
 		 2069 aa  60.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  27.13 
 
 		 721 aa  61.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  26.25 
 
 		 2713 aa  60.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  30 
 
 		 2027 aa  60.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1644  putative Ig  36.79 
 
 		 311 aa  60.1  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  44.17 
 
 		 672 aa  59.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>