87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1976 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  100 
 
 		 1367 aa  2746    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  42.05 
 
 		 9585 aa  134  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  29.95 
 
 		 6678 aa  107  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  26.3 
 
 		 1565 aa  92  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  33.16 
 
 		 4761 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3171  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  30.65 
 
 		 1364 aa  76.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  23.52 
 
 		 1147 aa  73.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1101 aa  73.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  26.05 
 
 		 2066 aa  72.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  28.43 
 
 		 252 aa  72  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.39 
 
 		 1064 aa  71.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0083  LamG domain-containing protein  30.33 
 
 		 430 aa  71.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  29.81 
 
 		 1150 aa  70.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  31.12 
 
 		 1035 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1576 aa  69.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03023  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.58 
 
 		 1355 aa  68.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  26.87 
 
 		 981 aa  68.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1931 aa  67.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  27.53 
 
 		 1072 aa  67.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  26.47 
 
 		 316 aa  67.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1314 aa  67  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  27.63 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1625  hypothetical protein  28.9 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0628  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  23.75 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2674  hypothetical protein  30.77 
 
 		 359 aa  64.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  26.7 
 
 		 1310 aa  64.3  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  33.09 
 
 		 646 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  22.8 
 
 		 1306 aa  63.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  26.99 
 
 		 1916 aa  63.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  29.55 
 
 		 4433 aa  63.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  29.91 
 
 		 1735 aa  61.6  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.59 
 
 		 1424 aa  61.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.43 
 
 		 864 aa  60.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2475  hypothetical protein  23.86 
 
 		 714 aa  58.9  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  29.67 
 
 		 739 aa  58.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  26.76 
 
 		 757 aa  57.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0941  hypothetical protein  28.31 
 
 		 747 aa  56.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.654154  hitchhiker  0.0000135929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  24.36 
 
 		 3273 aa  56.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  31.03 
 
 		 767 aa  57  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  33.88 
 
 		 1265 aa  56.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  27.39 
 
 		 4357 aa  56.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1389  hypothetical protein  35.56 
 
 		 362 aa  56.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.23 
 
 		 11716 aa  56.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  28.71 
 
 		 739 aa  55.5  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1164 aa  54.3  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  26.84 
 
 		 3507 aa  54.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.44 
 
 		 754 aa  53.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5589  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  30.67 
 
 		 1292 aa  53.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  31.32 
 
 		 793 aa  53.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.63 
 
 		 599 aa  53.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5363  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  26.01 
 
 		 265 aa  52.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  21.24 
 
 		 1600 aa  52.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  23.73 
 
 		 424 aa  52.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.65 
 
 		 598 aa  52.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1633  hypothetical protein  26.15 
 
 		 298 aa  52.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.2 
 
 		 1298 aa  52.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  29.09 
 
 		 249 aa  51.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  25 
 
 		 420 aa  51.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  33.7 
 
 		 643 aa  50.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  24.66 
 
 		 3907 aa  50.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  28.28 
 
 		 1159 aa  49.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  29.61 
 
 		 2223 aa  49.3  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  26.83 
 
 		 307 aa  49.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  25.85 
 
 		 846 aa  49.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1027  hypothetical protein  36.47 
 
 		 158 aa  48.9  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  25.93 
 
 		 2447 aa  48.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.95 
 
 		 594 aa  48.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.65 
 
 		 603 aa  48.5  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  22.09 
 
 		 531 aa  48.5  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  26.97 
 
 		 1013 aa  48.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1891  domain of unknown function DUF1735  26.77 
 
 		 377 aa  47.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.617686  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  23.74 
 
 		 587 aa  47.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5112  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.690635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  23.74 
 
 		 582 aa  47  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  28.21 
 
 		 756 aa  46.6  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  28.21 
 
 		 756 aa  46.6  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  28.21 
 
 		 756 aa  46.6  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  28.04 
 
 		 1133 aa  46.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1692  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.19 
 
 		 523 aa  47  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.27 
 
 		 236 aa  45.8  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3234  hypothetical protein  26.34 
 
 		 283 aa  46.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  28.83 
 
 		 250 aa  46.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  29.17 
 
 		 1597 aa  45.8  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  29.32 
 
 		 608 aa  45.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  29.7 
 
 		 247 aa  45.1  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3311  Protein of unknown function DUF1628  25.88 
 
 		 194 aa  45.1  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  29.7 
 
 		 247 aa  45.1  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>