22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3311 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3311  Protein of unknown function DUF1628  100 
 
 
194 aa  395  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2866  Protein of unknown function DUF1628  33.73 
 
 
169 aa  59.7  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711339  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2868  Protein of unknown function DUF1628  34.88 
 
 
152 aa  55.5  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24462 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1635  Protein of unknown function DUF1628  27.14 
 
 
136 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0569  Protein of unknown function DUF1628  25.22 
 
 
131 aa  48.1  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1390  hypothetical protein  34.57 
 
 
177 aa  48.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1960  Protein of unknown function DUF1628  29.05 
 
 
161 aa  48.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0791  Protein of unknown function DUF1628  29.89 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1959  Protein of unknown function DUF1628  33.02 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0792  Protein of unknown function DUF1628  26.09 
 
 
136 aa  46.6  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5067  hypothetical protein  29.67 
 
 
128 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211532  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5010  hypothetical protein  35.29 
 
 
172 aa  45.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  25.88 
 
 
1367 aa  45.1  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1778  hypothetical protein  42.55 
 
 
149 aa  44.7  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.38263 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1777  hypothetical protein  42.55 
 
 
149 aa  44.7  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.301806 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1218  hypothetical protein  43.48 
 
 
153 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0298  hypothetical protein  24.59 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.186262  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0267  hypothetical protein  24.07 
 
 
200 aa  42.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.93762  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3589  Protein of unknown function DUF1628  33.72 
 
 
215 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2415  Protein of unknown function DUF1628  40 
 
 
124 aa  42.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.506159  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1218  hypothetical protein  40.43 
 
 
128 aa  41.2  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0292  Protein of unknown function DUF1628  29.36 
 
 
151 aa  41.2  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>