20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2475 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2475  hypothetical protein  100 
 
 		 714 aa  1426    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  47.57 
 
 		 1164 aa  599  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1101 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  33.22 
 
 		 1147 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0554  LamG domain-containing protein jellyroll fold domain-containing protein  25 
 
 		 570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  34.72 
 
 		 2038 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1931 aa  90.5  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1692  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.24 
 
 		 523 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  25.74 
 
 		 958 aa  76.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0895  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.19 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  29.77 
 
 		 864 aa  74.7  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  26.88 
 
 		 948 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3504  LamG domain-containing protein  27.27 
 
 		 508 aa  72.8  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.17 
 
 		 1064 aa  68.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1367 aa  58.9  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  27.33 
 
 		 643 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1054 aa  51.2  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1375 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.87 
 
 		 11716 aa  45.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  20.59 
 
 		 1576 aa  44.3  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>