19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0895 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0895  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  100 
 
 
456 aa  900    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  37.83 
 
 
1147 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  31.07 
 
 
1101 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  31.09 
 
 
1164 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  33.18 
 
 
2038 aa  87.4  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2475  hypothetical protein  26.59 
 
 
714 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  25.39 
 
 
948 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  26.58 
 
 
958 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  38.85 
 
 
2585 aa  63.2  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3504  LamG domain-containing protein  30.37 
 
 
508 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  25.24 
 
 
1931 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  26.92 
 
 
864 aa  50.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0554  LamG domain-containing protein jellyroll fold domain-containing protein  26.05 
 
 
570 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2370  hypothetical protein  27.27 
 
 
216 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0389898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  28.51 
 
 
846 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  34.87 
 
 
1037 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1692  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.57 
 
 
523 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363459  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  29.73 
 
 
1375 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  33.09 
 
 
2046 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>